1,3 Propandiamin

3 Gammaproteobakterie

U Gammaproteobakterií byla pozorována velká rozmanitost polyaminových vzorů (tabulka 3). Hlavními složkami mohou být DAP, PUT, CAD a SPD samostatně nebo v kombinaci. Kromě toho mohou být přítomny HPUT, HSPD a SPM. Polyaminové vzorce jsou v rámci čeledí zřídka homogenní, ale často rodově specifické. SPD, někdy v kombinaci s jiným polyaminem, je hlavním polyaminem u druhů čeledí Oceanospirillaceae, Ectothiorhodospiraceae, Chromatiaceae, Halomonadaceae, některých rodů Xanthomonadaceae a Moraxellaceae, rodů Pseudoalteromonas, Idiomarina, Ferrimonas, některých druhů Thiothrix a jednoho druhu rodu Shewanella. PUT je charakteristickým hlavním polyaminem u Pseudidiomarina, Legionella, většiny druhů Shewanella a jednoho druhu Psychrobacter. Několik taxonů čeledí Moraxellaceae a Pasteurellaceae obsahuje jedinou hlavní složku DAP. Druhy rodu Moritella obsahují převážně CAD, ale Moritella yayanosii se vyznačuje hlavním polyaminem NSPD. CAD je také hlavní složkou u druhů Psychromonas, které mohou obsahovat také NSPD a PUT. Hlavní polyaminy CAD a SPD jsou charakteristické pro rod Alteromonas a také pro rody čeledi Xanthomonadaceae, Stenotrophomonas a Dyella, což je jasně odlišuje od ostatních rodů čeledi. Několik druhů rodu Shewanella (a Colwellia maris) obsahuje HPUT, diamin, který je charakteristickým znakem pro většinu betaproteobakterií, ale u jiných bakteriálních rodů nebyl zjištěn. Přítomnost tohoto diaminu však neodráží fylogenetické vztahy těchto druhů v rámci rodu Shewanella. Druhy čeledi Pseudomonadaceae obsahují hlavní polyaminy PUT a SPD a často také CAD. Druhy rodu Aeromonas obsahují jako hlavní složky DAP a PUT a může být přítomno i významné množství CAD. Druhy rodu Vibrio a několik druhů rodu Photobacterium obsahují jako převažující složku vzácný triamin NSPD. NSPD je také diagnostickým znakem rodu Pasteurella sensu stricto. Druhy této skupiny obsahují také hlavní polyamin PUT; přítomnost dalších hlavních složek DAP a CAD je variabilní. Ostatní rody v rámci čeledi Pasteurellaceae vykazují polyaminový vzorec buď s DAP a SPD (Avibacterium, Mannheimia), nebo PUT, SPD a variabilní pro DAP a CAD (Gallibacterium).

Čeleď Enterobacteriaceae vyžaduje samostatnou úvahu. Téměř všechny druhy přiřazených rodů obsahují hlavní diamant PUT a většina z nich obsahuje také hlavní množství DAP a/nebo CAD a některé také SPD. Rozdílné složení polyaminových vzorců bohužel jen zřídka odráží rodovou příslušnost. Nedávno jsme provedli studie korelace mezi fyziologickým stářím a odpovídajícími polyaminovými vzorci vybraných druhů Enterobacteriaceae, včetně Yersinia enterocolitica, Yersinia ruckeri, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii a Yokenella regenburgei (Amann, Frischmann a Busse, nepublikované výsledky). Výsledky těchto studií ukázaly, že fyziologické stáří biomasy, z níž byly polyaminy extrahovány, může výrazně ovlivnit výsledný polyaminový vzorec. V buňkách pozdní exponenciální fáze K. pneumoniae převažuje PUT a druhým hlavním polyaminem je DAP. Naopak v buňkách pozdní stacionární fáze převažuje CAD a PUT je druhým hlavním polyaminem. Tyto změny v obsahu polyaminů se projevují dvojnásobným snížením relativního množství DAP a PUT v buňkách pozdní stacionární fáze, zatímco množství CAD se desetinásobně zvyšuje. Při použití stejných testovacích podmínek je DAP hlavním polyaminem v E. cloacae a jeho relativní množství není téměř ovlivněno (sníženo z 51 % na 45 %) růstovou fází buněk. Současně se CAD zvyšuje z 2 % na 22 % a relativní množství PUT není rovněž ovlivněno. V buňkách pozdní exponenciální fáze Y. regensburgei je PUT hlavním polyaminem (54 %), zatímco ve stacionárních buňkách převažuje PUT a CAD (33,5±1,3 %). Relativní množství DAP je stabilní jak v buňkách pozdní exponenciální fáze, tak v buňkách stacionární fáze. Tyto výsledky naznačují, že část podílu PUT je v buňkách stacionární fáze nahrazena CAD. U C. freundii vykazují buňky obou fyziologických stáří stejný polyaminový vzorec s převahou DAP a PUT a stopami CAD. U Y. enterocolitica subsp. palearctica DAP chybí nebo je detekovatelný pouze ve stopovém množství. PUT je hlavním polyaminem, jehož podíl klesá z 94 % v buňkách rané exponenciální fáze na 84 % v buňkách stacionární fáze. Současně se zvyšuje relativní množství CAD ze 3 % na 14 %, což svědčí o částečném nahrazení PUT CAD. U jiného druhu Yersinia, Y. ruckeri, byl PUT hlavním polyaminem v buňkách rané exponenciální fáze, buňkách střední exponenciální fáze a buňkách rané stacionární fáze. Během stejných růstových fází se obsah DAP snížil ze 48 % na 3 %, zatímco obsah CAD se zvýšil ze 6 % na 58 %, což ukazuje na téměř úplné nahrazení DAP CAD. Srovnatelné výsledky byly získány také u dalších kmenů Y. ruckeri, což prokazuje druhovou specifičnost.

Tato data ukazují, že u druhů Enterobacteriaceae je polyaminový vzorec silně závislý na fyziologickém stáří buněk, z nichž jsou polyaminy získávány. Vzorek polyaminů získaný z buněk střední exponenciální fáze se může zřetelně lišit od vzorku z buněk stacionární fáze téhož kmene. Proto může být kmen zařazen do různých skupin v závislosti na fyziologickém stáří, ve kterém byla biomasa odebrána. Analýza biomasy bez přesného uvedení fyziologického věku, ve kterém byly polyaminy získány, není pro klasifikaci příslušníků čeledi Enterobacteriaceae užitečná. Většina údajů o polyaminech u druhů čeledi Enterobacteriaceae uvedených v tabulce 3 byla získána z článku Hamana (1996). V článku Hamana (1996) je uvedeno, že biomasa byla odebrána z buněk exponenciální nebo stacionární fáze, ale bez jasného údaje o fyziologickém stáří analyzovaných buněk. Proto údaje z Hamana (1996) nemohou sloužit pro klasifikační schéma založené na polyaminech pro druhy čeledi Enterobacteriaceae. Aby se prokázala hodnota tohoto přístupu pro klasifikaci druhů čeledi Enterobacteriaceae, je třeba provést pečlivou reanalýzu polyaminových vzorců na základě údajů získaných z biomasy standardizované z hlediska jejího fyziologického stáří

.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.