3 Gammaproteobakterier
En stor variation af polyaminmønstre er blevet observeret blandt Gammaproteobakterierne (Tabel 3). Hovedkomponenter kan være DAP, PUT, CAD og SPD alene eller i kombination. Desuden kan der være HPUT, HSPD og SPM til stede. Polyaminmønstrene er sjældent homogene inden for familierne, men ofte genusspecifikke. SPD, undertiden i kombination med et andet polyamin, er det vigtigste polyamin hos arter af familierne Oceanospirillaceae, Ectothiorhodospiraceae, Chromatiaceae, Halomonadaceae, visse slægter af Xanthomonadaceae og Moraxellaceae, slægterne Pseudoalteromonas, Idiomarina, Ferrimonas, visse arter af Thiothrix og en enkelt art af Shewanella-slægten. PUT er den karakteristiske hovedpolyamin hos Pseudidiomarina, Legionella, de fleste Shewanella-arter og en enkelt Psychrobacter-art. Flere taxa i familierne Moraxellaceae og Pasteurellaceae indeholder den eneste hovedkomponent DAP. Moritella-arter indeholder overvejende CAD, men Moritella yayanosii er kendetegnet ved den vigtigste polyamin NSPD. CAD er også den vigtigste komponent hos Psychromonas-arter, som også kan indeholde NSPD og PUT. De vigtigste polyaminer CAD og SPD er karakteristiske for slægten Alteromonas og også for slægterne Stenotrophomonas og Dyella i familien Xanthomonadaceae, hvilket klart adskiller dem fra de andre slægter i familien. Flere Shewanella-arter (og Colwellia maris) indeholder HPUT, en diamin, som er et karakteristisk træk for størstedelen af Betaproteobakterierne, men som ikke er påvist i andre bakteriestammer. Tilstedeværelsen af denne diamin afspejler imidlertid ikke disse arters fylogenetiske relationer inden for Shewanella-slægten. Arter i familien Pseudomonadaceae indeholder de vigtigste polyaminer PUT og SPD og ofte også CAD. Arter af slægten Aeromonas indeholder DAP og PUT som hovedbestanddele, og der kan også være betydelige mængder CAD til stede. Vibrio-arter og flere Photobacterium-arter indeholder den sjældne triamin NSPD som en fremherskende komponent. NSPD er også et diagnostisk træk for Pasteurella-slægten sensu stricto. Arter af denne gruppe indeholder også den vigtigste polyamin PUT; tilstedeværelsen af yderligere hovedkomponenter DAP og CAD er varierende. Andre slægter inden for familien Pasteurellaceae viser et polyaminmønster enten med DAP og SPD (Avibacterium, Mannheimia) eller PUT, SPD og variabel for DAP og CAD (Gallibacterium).
Familien Enterobacteriaceae kræver særskilt behandling. Næsten alle arter af de tildelte slægter indeholder den vigtigste diamant PUT, og størstedelen af dem indeholder også store mængder DAP og/eller CAD, og nogle indeholder også SPD. Desværre afspejler forskellige sammensætninger af polyaminmønstre kun sjældent slægtstilhørsforhold. Vi har for nylig gennemført undersøgelser af sammenhængen mellem den fysiologiske alder og de tilsvarende polyaminmønstre hos udvalgte Enterobacteriaceae-arter, herunder Yersinia enterocolitica, Yersinia ruckeri, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii og Yokenella regenburgei (Amann, Frischmann og Busse, upublicerede resultater). Resultaterne fra disse undersøgelser viste, at den fysiologiske alder af den biomasse, hvorfra polyaminerne blev ekstraheret, i høj grad kan påvirke det resulterende polyaminmønster. I celler i sen eksponentiel fase af K. pneumoniae er PUT fremherskende, og DAP er en anden vigtig polyamin. Derimod er CAD fremherskende i celler i sen stationær fase, og PUT er en anden vigtig polyamin. Disse ændringer i polyaminindholdet afspejles ved en dobbelt reduktion af de relative mængder af DAP og PUT i celler i sen stationær fase, mens mængden af CAD stiger 10 gange. Ved anvendelse af de samme testbetingelser er DAP det vigtigste polyamin i E. cloacae, og dets relative mængde er næsten upåvirket (reduceret fra 51 % til 45 %) af cellernes vækstfase. Samtidig øges CAD fra 2 % til 22 %, og de relative mængder af PUT er ligeledes upåvirket. I Y. regensburgei’s celler i sen eksponentiel fase er PUT det vigtigste polyamin (54 %), mens PUT og CAD er fremherskende i stationære celler (33,5 ± 1,3 %). Den relative mængde DAP er stabil i både celler i sen eksponentiel fase og i stationær fase. Disse resultater tyder på, at en del af PUT-delen erstattes af CAD i celler i stationær fase. I C. freundii viser celler i de to fysiologiske aldre de samme polyaminmønstre med DAP og PUT som dominerende stoffer og spor af CAD. I Y. enterocolitica subsp. palearctica er DAP ikke til stede eller kan kun påvises i spormængder. PUT er den vigtigste polyamin, som falder fra 94 % i celler i tidlig eksponentiel fase til 84 % i celler i stationær fase. Samtidig stiger den relative mængde CAD fra 3 % til 14 %, hvilket tyder på en delvis erstatning af PUT med CAD. I en anden Yersinia-art, Y. ruckeri, var PUT en vigtig polyamin i celler i tidlig eksponentiel fase, celler i midten af eksponentiel fase og celler i tidlig stationær fase. I de samme vækstfaser faldt indholdet af DAP fra 48 % til 3 %, mens indholdet af CAD steg fra 6 % til 58 %, hvilket viser en næsten fuldstændig erstatning af DAP med CAD. Der blev også opnået sammenlignelige resultater med yderligere stammer af Y. ruckeri, hvilket viser artsspecificitet.
Disse data viser, at i Enterobacteriaceae-arter er polyaminmønstret stærkt afhængigt af den fysiologiske alder af de celler, hvorfra polyaminerne udvindes. Et polyaminmønster, der er opnået fra celler i midten af eksponentiel fase, kan være klart forskelligt fra det fra celler i stationær fase af den samme stamme. En stamme kan derfor klassificeres i forskellige grupper afhængig af den fysiologiske alder, hvor biomassen blev høstet. En analyse af biomasse uden præcis angivelse af den fysiologiske alder, hvor polyaminerne udvindes, er ikke nyttig til klassificering af medlemmer af familien Enterobacteriaceae. Størstedelen af polyamindataene for arter af familien Enterobacteriaceae, der er anført i tabel 3, stammer fra Hamanas artikel (1996). I Hamana (1996) er det angivet, at biomassen blev indsamlet fra celler i eksponentiel eller stationær fase, men uden nogen klar angivelse af den fysiologiske alder af de analyserede celler. Dataene fra Hamana (1996) kan derfor ikke anvendes til et polyaminbaseret klassifikationsskema for arter af familien Enterobacteriaceae. Der skal foretages en omhyggelig genanalyse af polyaminmønstre baseret på data fra biomasse, der er standardiseret for dens fysiologiske alder, for at påvise værdien af denne fremgangsmåde til klassificering af arter af familien Enterobacteriaceae.