La tala selectiva es la práctica de eliminar sólo una o dos especies de árboles de una zona determinada. Como ya se ha mencionado, la tala selectiva es un método más eficiente en comparación con la tala rasa, pero sigue teniendo efectos negativos. La tala selectiva en la selva amazónica ha pasado de la explotación de bajo volumen de una o dos especies a un sistema que permite talar múltiples especies y seguir siendo rentable. Es uno de los muchos usos de la tierra en las fronteras en desarrollo de la Amazonia. Sin embargo, el crecimiento de esta industria no está correlacionado con una gestión eficiente y mejores técnicas de explotación. Aunque hay muchos avances en la gestión forestal, como la tala de impacto reducido (RIL), no se han adoptado de forma generalizada. Entre las razones por las que se prefieren las técnicas de tala selectiva perjudiciales a la EIR se encuentran: los derechos de propiedad poco claros, los elevados costes de transacción del gobierno y la falta de información accesible sobre las técnicas de gestión forestal. La EIR también afecta a la regeneración de los árboles porque crea huecos en el dosel más pequeños que restringen la luz natural que los árboles en regeneración necesitan para sobrevivir.
Dos formas de obtener permiso para talar los bosques en la Amazonia brasileña son a través de planes de gestión forestal regulados por políticas y la deforestación. Entre 2000 y 2004 se registraron casi 15 millones de m3 de madera mediante estos permisos, pero entre 1998 y 2004 se registraron más de 24 millones de metros cúbicos (850×106 pies cúbicos). Gran parte de la producción de estos años procedía de la tala ilegal. La tala ilegal supone una pérdida de impuestos para el gobierno y un escaso avance económico en los sectores relacionados con la tala. Además, la tala ilegal provoca el empobrecimiento de los bosques, la pérdida de biodiversidad y el aumento de la probabilidad de incendios.
La intensidad de la tala tiene un efecto directo en el avance ecológico. Inicialmente, la cubierta forestal disminuye como resultado de la tala selectiva, lo que conduce a una ralentización del crecimiento del bosque, de los procesos hidrológicos y del suministro de alimentos. Además de alterar la estructura del bosque, la tala selectiva también altera el ciclo del carbono y otros procesos biogeoquímicos clave que ayudan a controlar y mantener la productividad del bosque. Los efectos de la tala selectiva pueden desglosarse en tres componentes principales: daños en el suelo como resultado de las operaciones de tala, patrones temporales de la fracción de hueco del dosel dentro de cada categoría de daños en el suelo, y cambios temporales en la fracción de hueco resultante de los árboles talados. La fracción de hueco en el dosel es el efecto integrado de varias propiedades biofísicas dependientes de la escala que proporcionan información sobre la apertura del dosel tras la tala selectiva. Los senderos son los que más contribuyen a los daños en el suelo, pero las plataformas de troncos y los caminos fueron pequeños componentes de los daños totales en el suelo. Sin embargo, los diferentes métodos y técnicas de tala dan lugar a diferentes niveles de daños en el suelo. A pesar de que las técnicas de tala son similares, los métodos de tala convencionales producen más daños en el suelo que la tala de impacto reducido.
La tala selectiva es uno de los muchos usos de la tierra en la Amazonia brasileña, pero también aumenta el acceso humano a los bosques mediante el desarrollo de una multitud de caminos de tala. Estas carreteras facilitan el acceso a los lugares de tala, pero también facilitan el acceso de los cazadores a los terrenos forestales, lo que reduce la biodiversidad dentro del bosque. Además, es más probable que la tala se realice alrededor de estas carreteras porque la facilidad de acceso permite obtener más beneficios. Esto da lugar a grandes fracciones de huecos y a altas tasas de deforestación. Inevitablemente, la probabilidad de deforestación es mayor en el caso de las talas selectivas mal gestionadas en el bosque que en las que no lo están. Estos aumentos en las aperturas de las copas de los árboles provocan la degradación y el aumento de la susceptibilidad a los incendios. La fragmentación de los bosques también se produce como resultado de la tala de alto impacto en un bosque. Los impactos de la tala en la Amazonia brasileña se traducen en la fragmentación de los bosques a medida que se producen nuevas áreas de bosques para la tala de árboles o la tala selectiva.
Casi la mitad de las operaciones de tala selectiva en la Amazonia eran ilegales a principios de la década de 2000. Dado que gran parte de las prácticas de tala no estaban reguladas, las operaciones de extracción de grandes daños hicieron que las tierras forestales fueran susceptibles a la sequía y a los incendios. En los bosques recientemente talados, las fracciones de huecos en el dosel son más altas en las cubiertas de troncos, sin embargo, el efecto global en la fracción de huecos del bosque es insignificante debido a la pequeña superficie de las cubiertas.