Les traitements qui endommagent le DNA tels que les rayonnements ultraviolets ou ionisants induisent chez la bactérie Escherichia coli un ensemble de fonctions appelé la réponse SOS, discutée ici. La régulation de la réponse SOS implique un répresseur, la protéine LexA, et un inducteur, la protéine RecA. Après endommagement du DNA une petite molécule « effecteur est produite — peut-être du DNA simple brin — qui active la protéine RecA en une forme capable de catalyser le clivage protéolytique de LexA. Les répresseurs de certains prophages tempérés sont clivés dans les mêmes conditions, aboutissant à l’induction lysogénique. Les fonctions SOS sont impliquées dans la réparation et la mutagénèse du DNA, dans l’inhibition de la division cellulaire, dans le retour à l’état physiologique normal après réparation du DNA, enfin peut-être dans la mort cellulaire lorsque l’endommagement du DNA est trop étendu. La réponse SOS comprend également des gènes chromosomiques de fonction inconnue, plusieurs gènes plasmidiques (bactériocines, mutagénèse), et l’induction lysogénique de certains prophages. Les traitements qui endommagent le DNA semblent introduire des activités de réparation et de mutagénèse du DNA, et le développement proviral dans de nombreuses espèces, y compris les cellules de mammifères. En général, les substances qui sont génotoxiques aux eucaryotes supérieurs induisent la réponse SOS chez les bactéries. Cette corrélation est la base des nombreux tests bactériens pour la génotoxicité et la carcinogénicité.
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