I dati di 1000 Genomes in Ensembl
Ensembl fornisce un genome browser dove i dati del Progetto 1000 Genomes possono essere visualizzati insieme a una vasta gamma di fonti di dati aggiuntive, oltre a dare accesso a strumenti che possono essere utilizzati per lavorare con i dati di 1000 Genomes e altri set di dati.
In Ensembl, i dati possono essere visualizzati sia sul gruppo di riferimento GRCh37 (utilizzato dalla fase finale del Progetto 1000 Genomi) o sul genoma di riferimento attuale, GRCh38.
- Ensembl GRCh37 – visualizza i dati del Progetto 1000 Genomi sul genoma di riferimento utilizzato dal progetto
- Ensembl GRCh38 – visualizza i dati del Progetto 1000 Genomi sull’attuale genoma umano di riferimento
Durante il Progetto 1000 Genomi, i dati sono stati condivisi il prima possibile tramite browser di accesso rapido per ciascuna delle fasi di produzione dei dati del progetto. Questi sono stati creati per consentire la navigazione prima che i dati fossero disponibili in Ensembl e ora sono stati ritirati. Se avete domande relative a questo, contattate [email protected].
Tutorial e guide
Ci sono suggerimenti per Ensembl sia sul sito principale di Ensembl che sul loro blog.
L’NCBI fornisce anche un browser dei 1000 genomi ospitato sul loro sito.