Nel 1589, Parigi era effettivamente nelle mani della Lega Cattolica. Per sfuggire, Enrico IV di Francia convocò il parlamento di Parigi a Tours, ma solo una piccola fazione dei suoi parlamentari accettò la convocazione. (Enrico tenne anche un parlamento a Châlons, una città rimasta fedele al re, conosciuto come il Parlamento di Châlons). Dopo l’assassinio del re da parte del fratello laico domenicano Jacques Clément, il “Parlamento di Tours” continuò a riunirsi durante i primi anni del regno di Enrico IV di Francia. Anche i membri monarchici degli altri parlamenti provinciali si divisero: i membri monarchici del Parlamento di Rouen si separarono a Caen, quelli del Parlamento di Tolosa a Carcassonne, e quelli del Parlamento di Digione a Semur e a Flavigny.
Il Parlamento di Parigi ebbe un ruolo importante nello stimolare la nobiltà a resistere all’espansione del potere reale con la forza militare nella Fronda parlamentare, 1648-1649. Alla fine, il re Luigi XIV ebbe la meglio e la nobiltà fu umiliata.
In una sessione del Parlamento di Parigi del 3 marzo 1766 conosciuta come la Séance de la Flagellation (“la Sessione della Flagellazione”), Luigi XV affermò che il potere sovrano risiedeva solo nella sua persona.