択伐とは、ある地域から1、2種類の樹木だけを取り除くことです。 前述したように、択伐は皆伐と比較するとより効率的な方法ですが、それでもマイナスの影響はあります。 アマゾンの熱帯雨林における択伐は、1～2種の少量伐採から、複数種の伐採が可能で採算が取れるシステムへと移行しています。 アマゾンのフロンティア開発における多くの土地利用の一つとなっています。 しかし、この産業の成長は、効率的な管理や優れた伐採技術とは相関していない。 森林管理には、Reduced Impact Logging（RIL）のような多くの進歩がありますが、広く採用されるには至っていません。 RILよりも有害な択伐技術が好まれる理由として、財産権が不明瞭であること、政府の取引コストが高いこと、森林管理技術に関する情報が入手しにくいこと、などが挙げられます。 RILはまた、樹冠の隙間を小さくして、再生する木が生き残るために必要な自然光を制限するので、木の再生に影響を与えます。
ブラジル・アマゾンで森林伐採の許可を得るには、政策的に規制された森林管理計画と森林破壊を利用する方法があります。 2000年から2004年の間に、これらの許可を通じて1500万m3近くの木材が記録されましたが、1998年から2004年の間には2400万立方メートル（850×106立方フィート）以上が記録されました。 これらの年の生産量の多くは、違法伐採によるものである。 違法伐採は、政府の税金の損失や伐採関連部門の経済的な進歩の悪さにつながる。 さらに、違法伐採は森林の貧困化、生物多様性の損失、火災の確率の上昇をもたらす。
すべての伐採作業の強度は、生態系の進歩に直接的な影響を与える。 当初、選択的伐採の結果、森林の樹冠被覆が減少し、それが森林の成長、水文学的プロセス、食糧供給の減速につながる。 択伐は森林構造の変化だけでなく、炭素循環や、森林の生産性を制御・維持するためのその他の重要な生物地球化学的プロセスも変化させます。 択伐の影響は、伐採作業による地面ダメージ、地面ダメージの各カテゴリーにおけるキャノピーギャップ率の時間的パターン、伐採木によるギャップ率の時間的変化の3つの主要な要素に分解することができる。 樹冠隙間率は、規模に依存するいくつかの生物物理学的特性の統合効果であり、選択的伐採後の樹冠の開放性に関する情報を提供するものである。 トレイルは地上被害の最大の要因であるが、ログデッキと道路は地上被害全体の小さな構成要素であった。 しかし、伐採方法や技術が異なれば、地表被害レベルも異なる。
択伐はブラジル・アマゾンの多くの土地利用の一つであるが、多数の伐採路の開発を通じて森林への人間のアクセスも増加させている。 これらの道路は、伐採現場へのアクセスを容易にする一方で、ハンターが林地にアクセスすることを容易にし、森林内の生物多様性を減少させる。 また、伐採は道路周辺に集中しがちですが、これはアクセスが容易であればあるほど利益が上がるからです。 このため、ギャップが大きくなり、森林伐採の割合が高くなる。 必然的に、森林の管理が不十分な択伐地では、そうでない場所よりも森林破壊の確率が高くなる。 このような樹冠の開口部の増加は、劣化や火災の影響を受けやすくする。 森林の断片化も、インパクトの強い伐採の結果として引き起こされる。 ブラジル・アマゾンでの伐採の影響は、皆伐や択伐のために新たな森林が生み出され、結果として森林の分断を引き起こしています
2000年代初頭、アマゾンでの択伐作業のほぼ半分が違法とされました。 伐採方法の多くが規制されていなかったため、ダメージの大きい伐採作業によって、林地は干ばつや火災の影響を受けやすくなっていました。 最近伐採された森林では、キャノピーギャップ率はログデッキで最も高いが、デッキの表面積が小さいため、森林ギャップ率への全体的な影響は無視できる程度である。