Procedures for Analysis of Comparative Data Using Phylogenetically Independent Contrasts

Felsenstein (1985, Am. Nat. 125: 1-15) procedures to test correlated evolution of continuous traitsの適用についていくつかの点を議論し明らかにした。 これは表現型形質のデータを既存の系統樹（独立した情報から得られる）にマッピングする、利用可能ないくつかの比較手法の一つである。 Felsensteinの方法の適用には、完全に二分的なトポロジーは必要ない。 また、ブラウン運動でモデル化されるような、漸進的で時計のような特性進化を仮定する必要もない。 枝の長さは、遺伝的距離、化石記録や分子時計から推定される分岐時間、系統分析から得られる特性変化の数など、入手可能なほぼすべての情報を使って推定することが可能である。 しかし、提案された分岐長が統計的に適切であるかどうかは、各植物系統と各特徴について経験的に検証されなければならない。 その方法は，標準化された独立対比とその標準偏差（すなわち，枝長の和の平方根）のプロットのグラフ分析に基づく，簡単な方法を提案する。 場合によっては、枝の長さおよび/または研究されている形質の値の変換が必要になることがある。 哺乳類の生息域面積のスケーリングを含む例が示されている。 十分に標準化されたら、独立した対照のセットは、線形または非線形（重）回帰のいずれかを使用して分析することができる。 しかし、どのような場合でも、回帰（または相関）は原点を通るように計算されなければならない。 また、ボディサイズ効果を補正する方法と、標準化された独立対照の関係をグラフ化することとの関連についても説明する。 最後に独立対比法で分析できる形質の種類を考察し、遺伝のメカニズム（例：遺伝的または文化的）に関係なく、祖先から受け継いだあらゆる（連続的）形質が分析に適していると結論づけた＜6036＞。