1000 Genomes data in Ensembl
Ensembl biedt een genoombrowser waar de gegevens van het 1000-genomenproject kunnen worden bekeken naast een breed scala van andere gegevensbronnen, en geeft ook toegang tot instrumenten die kunnen worden gebruikt om met de 1000-genoomgegevens en andere gegevensreeksen te werken.
In Ensembl kunnen de gegevens worden bekeken op de GRCh37-referentie-assemblage (gebruikt door de laatste fase van het 1000-genomenproject) of op het huidige referentiegenoom, GRCh38.
- Ensembl GRCh37 – bekijk de 1000-genomeprojectgegevens op het referentiegenoom dat door het project wordt gebruikt
- Ensembl GRCh38 – bekijk de 1000-genomeprojectgegevens op het huidige menselijke referentiegenoom
Tijdens het 1000-genomeproject werden de gegevens zo snel mogelijk gedeeld via browsers voor vroege toegang voor elk van de fasen van gegevensproductie van het project. Deze werden gecreëerd om te kunnen browsen voordat de gegevens beschikbaar waren in Ensembl en zijn nu buiten gebruik gesteld. Als u hierover vragen hebt, kunt u contact opnemen met [email protected].
Tutorials en gidsen
Er zijn tips voor Ensembl zowel op de hoofdsite van Ensembl als op hun blog.
De NCBI stelt ook een 1000-genomenbrowser ter beschikking die op hun site wordt gehost.