Proteïnemutatiefrequentie in kanker
De ‘lollipop-plot’ hierboven toont recurrente (waargenomen in 3 of meer van de 4440 TCGA-tumormonsters van 15 kankertypes) en dus potentieel oncogene missense-mutaties (klik op ‘Toon kankermutaties’). De staafdiagram hieronder toont de proportie tumormonsters die een of meer mutaties in het gegeven eiwit hebben.
Meer informatie over de integratie van kankergegevens in PhosphoSitePlus:
We integreerden 4440 tumormonsters van 15 kankertypen uit TCGA (The Cancer Genome Atlas). Om meer gedetailleerde mutatie-informatie op te halen, raden wij cBioPortal aan.
Wij hebben de volgende kankertypen geïntegreerd:
– Acute Myeloïde Leukemie (TCGA, NEJM 2013)
– Blaas Urotheliaal Carcinoom (TCGA, Nature 2014)
– Borst Invasief Carcinoom (TCGA, Cell 2015)
– Colorectaal Adenocarcinoom (TCGA, Nature 2012)
– Glioblastoma (TCGA, Cell 2013)
– Head and Neck Squamous Cell Carcinoma (TCGA, Nature 2015)
– Kidney Chromophobe (TCGA, Cancer Cell 2014)
– Kidney Renal Clear Cell Carcinoma (TCGA, Nature 2013)
– Long Adenocarcinoom (TCGA, Nature 2014)
– Long Squameus Cel Carcinoom (TCGA, Nature 2012)
– Ovarium Serous Cystadenocarcinoma (TCGA, Nature 2011)
– Papillair Schildklier Carcinoom (TCGA, Cell 2014)
– Prostaat Adenocarcinoom (TCGA, Cell 2015)
– Maag Adenocarcinoom (TCGA, Nature 2014)
– Uterine Corpus Endometrium Carcinoom (TCGA, Nature 2013)