Case 1
Een slokdarmkankerpatiënt die werd gediagnosticeerd als S. haliotis longontsteking.
Een 68-jarige mannelijke patiënt werd op 24 juli 2016 opgenomen in het volksziekenhuis van de stad Liaocheng, China, vanwege “hematemesis gedurende 4 uur”. Hij was gediagnosticeerd met de operatie van slokdarmkanker voor meer dan 2 jaar. Zijn opgenomen lichamelijke onderzoeken waren lichaamstemperatuur van 36,3 °C, polsslag 92 slagen/min, ademhaling van 22 keer/min en bloeddruk 135/80 mmHg. Niet palpabele vergroting van bilaterale hals en supraclaviculaire lymfeklieren, trachea in het midden, pectorale symmetrie, zichtbare littekens op rechterborst, duidelijk percussiegeluid bij dubbele long, auscultatie van grof ademgeluid, geen droge en natte rales, regelmatig ritme, percussie geen pijn van de nierstreek, negatief voor verschuivende dofheid en darmgeluiden van 3 keer/min. Zijn opnamediagnose was slokdarmkanker na operatie en hypertensie. Bij opname werden de hulponderzoeken uitgevoerd om de bron van hematemesis vast te stellen. De pijnloze gastroscopie werd uitgevoerd, maar er werden geen duidelijke afwijkingen waargenomen. Het pijnloze bronchoscopisch onderzoek onthulde posterieure basale segment van de linker onderste kwab bloeding. Penseel pathologie aangegeven geen duidelijke tumorcellen. Thoracale en abdominale verbeterde computertomografie-scan toonde aan dat hij oesofaguschirurgie, bronchitis en emfyseem, middenkwab van de rechter longknobbels, rechter bovenkwab en linker onderkwab interstitiële laesies en de onderkwab van de linker long ontsteking had. Hij kreeg medicijnen (3 g cefoperazon/sulbactam werd gedurende 6 dagen tweemaal per dag toegediend) en een therapie van antikanker, ontstekingsremmers, rehydratie en hemostase. Na een behandeling van zes dagen verbeterden zijn symptomen en werd de patiënt uit het ziekenhuis ontslagen.
De bronchoalveolaire lavagevloeistof (BALF) werd afgenomen toen hij pijnloos bronchoscopisch onderzoek onderging en het celgetal meer dan 104 kve/ml was. Het monster werd gestreept geïnoculeerd op bloedagar medium voor bacteriële cultuur. Stammen met verschillende fenotypische kenmerken op bloedplaten werden geïsoleerd en geïdentificeerd als S. algen, Escherichia coli en Klebsiella pneumoniae door VITEK 2 systeem met behulp van de ID-GN kaart (boiMérieux). Aangezien slechts twee Shewanella-soorten, S. putrefaciens en S. algen, in de database van het VITEK 2-systeem waren geregistreerd, werd de sequentie van het 16S rRNA-gen geamplificeerd met een eerder beschreven PCR . Het PCR-product werd gesequeneerd en de nucleotidesequentie werd gedeponeerd in GenBank, onder het toetredingsnummer MF589233. BLAST-analyse van de 16S rRNA-gensequentie bij GenBank toonde een overeenkomst van 99,0% met de type-stam van S. haliotis DW01 (toetredingsnummers NR_117770.1). Verdere fylogenetische analyse met alle type-sequenties van Shewanella-soorten die in de GenBank-database beschikbaar zijn, bevestigde dat de stam werd geïdentificeerd als een soort van S. haliotis (LC2016-1 in Fig. 1).
Fylogenetische boom geconstrueerd door de neighbor-joining methode op basis van de nucleotidesequenties van het 16S rRNA-gen. De fylogenetische boom werd geconstrueerd op basis van een uitlijning van 1427 nt en alle bekende typestammen van de Shewanella-soorten werden erin opgenomen. De getallen op de knooppunten geven de bootstrap-waarden aan (percentage van 1000 replicaten). Balk, 10 substituties per nucleotidepositie. Vetgedrukte letters geven de stammen van de gevallen I en II aan. GenBank-toetredingsnummers van 16S rRNA-gensequenties stonden tussen haakjes. De zwarte driehoek bestond uit vierenvijftig Shewanella-soorten. Soortennamen en GenBank-toetredingsnummers van 16S rRNA-gensequenties werden vermeld in Additional file 1: Table S1
Om de samenstelling van de bacteriegemeenschap en de rijkdom van het BALF verder te bevestigen, werd het monster onderworpen aan de 16S rRNA-ampliconsequencing . Het resultaat gaf aan dat de bacteriële samenstelling van de gemeenschap geslachten van Shewanella (88,34%), Escherichia (11,11%) en Streptococcus (0,38%), et al. omvatte, terwijl de meerderheid van de geslachten Shewanella was.
Antibiotische gevoeligheidstests werden uitgevoerd door microdilutie methode op Mueller-Hinton bouillon. De stam was gevoelig voor piperacilline/tazobactam (minimale remmende concentratie, MIC: 8 μg/ml), ceftazidime (1 μg/ml), cefepime (1 μg/ml), amikacine (2 μg/ml), gentamicine (1 μg/ml), imipenem (4 μg/ml), meropenem (4 μg/ml), maar was resistent tegen ciprofloxacine (8 μg/ml) en levofloxacine (8 μg/ml).
Zaak 2
Een maagkankerpatiënt bij wie de diagnose S. algenbacteriëmie werd gesteld.
Een 56-jarige man werd opgenomen in het volksziekenhuis van de stad Liaocheng, China, op 6, okt. 2016, vanwege “ongemak van bovenbuikpijn gedurende 1 maand”. Zijn opgenomen lichamelijk onderzoek omvatte lichaamstemperatuur van 36,1 graden, polsslag van 72 slagen/min, ademhaling 18 keer/min en bloeddruk 140/90 mmHg. Detectie van niet palpabele vergroting van bilaterale hals en supraclaviculaire lymfeklieren, vlakke buik, geen gastro-intestinale of peristaltische golven werden waargenomen. Zachte buikspieren, milde gevoeligheid in de bovenbuik en geen duidelijke rebound pijn werden gemeld. Zijn lever en milt raakten niet onder de rib en er werd geen palpabele massa ontdekt. Negatief voor verschuivende saaiheid, normale darmgeluiden en geen abnormaal van rectaal onderzoek werden gedetecteerd. De gastroscoop suggereerde zichtbare zweer laesies aan de hartstreek waarbij de maag fundus en maag lichaam. De pathologische resultaten wezen op adenocarcinoom. Zijn opnamediagnoses waren maagkanker en hypertensie.
Bij opname werden de hulponderzoeken uitgevoerd op 9 okt. 2016. Laparoscopie gaf aan dat hij in het late stadium tumoren was zonder radicale resectie. Hij kreeg vervolgens intraveneuze en intraperitoneale chemotherapie, gevolgd door ernstige beenmergonderdrukking met bloedcellen en bloedplaatjes aanzienlijk lager dan normaal. Hij kreeg verdere behandeling van anti-infectie, voedingsondersteuning, rehydratie, het stimuleren van granulopoiese en symptomatische behandeling. Op 26 okt. 2016 had patiënt kortademigheid, hartslag en andere symptomen met longademhalingsgeluiden ruw, en geen rales, ledematen koud. Hij werd beschouwd als het bestaan van septische shock. Hij kreeg niet-invasieve mechanische beademing en vloeistof expansie, colloïde, bloedtransfusie producten, anti infectie (1 g imipenem werd toegediend elke 8 uur gedurende 7 dagen), onderhouden van de circulatie, zuur onderdrukking, lever bescherming, nutritionele ondersteuning, onderhoud van water en elektrolyten zuur-base evenwicht, monitoring van de bloeddruk, hartslag, respiratoire functie, uur urine volume en bloeden. Patiënt had een ernstige infectie en de aanwezigheid van een meervoudig orgaan disfunctie syndroom (ademhaling, circulatie, gastro-intestinale, bloed en nieren). Patiënt en zijn familieleden eisten automatisch ontslag voor hospicezorg. Zijn ontslagdiagnoses waren meervoudig orgaan disfunctie syndroom (ademhaling, bloedsomloop, gastro-intestinaal, bloed en nieren), maagkanker en hypertensie.
Na het verschijnen van septische shock, werd zijn bloedkweek bemonsterd om de bacteriën te scheiden. De microbiële groei werd gedetecteerd in zowel anaerobe als aerobe flessen en de positieve gerapporteerde tijd was respectievelijk 8,1 en 11,9 uur. Beide flessen leverden een uniforme Gram-negatieve bacil op. Na 24 uur incubatie groeiden hemolytische, oxidase-positieve gele kolonies op bloedagar. De stam werd geïdentificeerd als S. putrefaciens met behulp van het VITEK 2-systeem en de ID-GN-kaart (boiMérieux). De 16S rRNA-gensequentie van de stam werd gedeponeerd bij GenBank (toetredingsnummer: MF589234). BLAST-analyse op GenBank toonde een overeenkomst van 100,0% met S. upenei stam VITVAGJ (toetredingsnummers KP090164.1). Verdere fylogenetische analyse met alle type-sequenties van Shewanella-soorten beschikbaar in de GenBank database, bevestigde dat de stam behoorde tot de soort van S. upenei (LC2016-5 in Fig. 1). Op de dag van de bloedafname werd ook zijn peritoneale drainagevloeistof afgenomen en gekweekt met behulp van dezelfde identificatiemethoden, en de resultaten van de bacteriële identificatie en de gevoeligheid voor geneesmiddelen waren consistent met die van het bloed.
Antibiotische gevoeligheidstests werden uitgevoerd door middel van microdilutiemethode op Mueller-Hinton-bouillon. De stam was gevoelig voor aztreonam (1 μg/ml), ceftazidime (1 μg/ml), cefepime (1 μg/ml), amikacine (2 μg/ml) gentamicine (1 μg/ml) en levofloxacine (1 μg/ml), maar was intermediair ten opzichte van imipenem (8 μg/ml), piperacilline/tazobactam (64 μg/ml) en ciprofloxacine (2 μg/ml).