RasGEF-domein is een domein dat voorkomt in de CDC25-familie van guaninenucleotide-uitwisselingsfactoren voor Ras-achtige kleine GTPasen.
| RasGEF-domein | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
Structuur van menselijk H-Ras.
|
|||||||
| Identifiers | |||||||
| Symbol | RasGEF | ||||||
| Pfam | PF00617 | ||||||
| InterPro | IPR001895 | ||||||
| SMART | RasGEF | ||||||
| PROSITE | PDOC00594 | ||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM eiwit | 1xd4 | ||||||
| CDD | cd00155 | ||||||
| Beschikbare eiwitstructuren: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | |||
Ras-eiwitten zijn membraan-geassocieerde moleculaire schakelaars die GTP en GDP binden en GTP langzaam hydrolyseren tot GDP. Het evenwicht tussen de GTP-gebonden (actieve) en de GDP-gebonden (inactieve) toestand wordt geregeld door de tegengestelde werking van eiwitten die de GTPase-activiteit activeren en die van eiwitten die het verlies van gebonden GDP en de opname van vers GTP bevorderen. Deze laatste eiwitten staan bekend als guanine-nucleotide dissociatie stimulatoren (GDS’s) (of ook als guanine-nucleotide vrijmakende (of uitwisselings) factoren (GRF’s)). Eiwitten die als GDS fungeren kunnen op basis van sequentie-overeenkomst in tenminste twee families worden ingedeeld, de CDC24 familie (zie InterPro: IPR001331) en deze CDC25 (RasGEF) familie.
De omvang van de eiwitten van de CDC25 familie varieert van 309 residuen (LTE1) tot 1596 residuen (sos). De sequentie-overeenkomst die al deze proteïnen gemeen hebben, is beperkt tot een gebied van ongeveer 250 aminozuren dat zich over het algemeen in hun C-terminale gedeelte bevindt (momenteel zijn sos en ralGDS de enige uitzonderingen, waar dit domein het centrale deel van het proteïne uitmaakt). Van dit domein is aangetoond, in CDC25 en SCD25, dat het essentieel is voor de activiteit van deze eiwitten.