Procedures for the Analysis of Comparative Data Using Phylogenetically Independent Contrasts

Discutăm și clarificăm câteva aspecte ale aplicării procedurilor lui Felsenstein (1985, Am. Nat. 125: 1-15) pentru a testa evoluția corelată a trăsăturilor continue. Aceasta este una dintre cele câteva metode comparative disponibile care mapează datele pentru trăsăturile fenotipice pe un arbore filogenetic existent (derivat din informații independente). Aplicarea metodei Felsenstein nu necesită o topologie complet dihotomică. De asemenea, nu necesită presupunerea unei evoluții graduale, ca un ceas, a caracterelor, așa cum ar putea fi modelată de mișcarea browniană. Aproape orice informație disponibilă poate fi utilizată pentru a estima lungimile ramurilor (de exemplu, distanțele genetice, timpii de divergență estimați din arhiva fosilă sau din ceasurile moleculare, numărul de modificări ale caracterelor dintr-o analiză cladistică). Cu toate acestea, adecvarea în scopuri statistice a oricărei lungimi de ramură propuse trebuie să fie verificată empiric pentru fiecare fitogenie și pentru fiecare caracter. Sugerăm o modalitate simplă de a face acest lucru, bazată pe analiza grafică a graficelor contrastelor independente standardizate în raport cu abaterile lor standard (adică rădăcinile pătrate ale sumelor lungimilor ramurilor lor). În unele cazuri, lungimile ramurilor și/sau valorile caracterelor studiate vor necesita transformare. Este prezentat un exemplu care implică scalarea suprafeței domeniului vital al mamiferelor. Odată ce au fost standardizate în mod adecvat, seturile de contraste independente pot fi analizate folosind fie regresia liniară, fie cea neliniară (multiplă). Cu toate acestea, în toate cazurile, regresiile (sau corelațiile) trebuie să fie calculate prin origine. Discutăm, de asemenea, modalitățile de corectare a efectelor mărimii corpului și modul în care acest lucru se referă la realizarea reprezentărilor grafice ale relațiilor dintre contraste independente standardizate. Încheiem cu o analiză a tipurilor de trăsături care pot fi analizate cu proceduri de contraste independente și concluzionăm că orice trăsătură (continuă) care este moștenită de la strămoși este adecvată pentru analiză, indiferent de mecanismul de moștenire (de exemplu, genetic sau cultural).

.

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată.