Pessoal Associado:
- Kate Reardon, Microbióloga de Pesquisa
- Katherine Son, Técnica de Ciências Físicas
- Vacant, Associada de Pesquisa, Microbióloga (Solos)
- Vacant, Técnica de Laboratório
- ARS-SWCR Scientists
Colaboradores:
- Mark Mazzola, USDA-ARS Tree Fruit Research Lab, Wenatchee, WA
- David Brown, Washington State University, Pullman, WA
- Kristin Trippe, USDA-ARS Forage Seed and Cereal Research, Corvallis, OR
- Dick Smiley, Oregon State University, Adams, OR
- Marion Brodhagen, Western Washington University, Bellingham, WA
- Jeff McLean, J. Craig Venter Institute, La Jolla, CA
Projetos de Pesquisa Atuais
Micróbios do solo contribuem significativamente para a ciclagem de nutrientes e disponibilidade de nitrogênio em solos agrícolas. Minha pesquisa se concentra em como as estratégias de manejo agrícola impactam as comunidades microbianas nativas do solo e a influência que os sistemas de cultivo têm sobre a dinâmica do nitrogênio e do carbono. Em um esforço para compreender estes efeitos, estamos empregando técnicas moleculares para quantificar e identificar micróbios incluindo bactérias, fungos, arcaias e nematóides importantes na ciclagem de nutrientes em solos agrícolas. Estamos também analisando mudanças na abundância de genes necessários para certas funções microbianas como o ciclo do nitrogênio. Analisando os genes funcionais, tais como o gene que codifica a amônia monooxigenase que catalisa o primeiro passo da conversão da amônia em nitrito, podemos fazer suposições sobre como as estratégias de manejo, tais como rotação de culturas ou fertilização nitrogenada impactam a oxidação microbiana da amônia.
As capacidades de biologia molecular são novas no programa de microbiologia USDA-ARS em Pendleton e atualmente incluem extração de DNA/RNA, eletroforese em gel, PCR (reação em cadeia da polimerase), PCR quantitativa, T-RFLP (para determinar mudanças na diversidade microbiana, polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição terminal), seqüenciamento de DNA e quantificação de DNA/RNA usando fluorescência ou um Bioanalisador.