Allscripts Healthcare Solutions, gemeinhin einfach als Allscripts bezeichnet, wurde ursprünglich 1982 unter dem Namen Medic Computer Systems von Glen Tullman gegründet. Der Name wurde 1986 in Allscripts geändert.
Das Unternehmen bietet niedergelassenen Ärzten, Krankenhäusern und ähnlichen Gesundheitsdienstleistern Praxismanagement und ERH-Technologie (Electronic Health Record). Allscripts bietet auch Lösungen für die Einbindung von Patienten und die Koordination der Pflege sowie Finanz- und Analysetechnologien an.
Zurzeit hat das Unternehmen mehr als 180.000 Arztnutzer und verfügt über Lösungen in 2.700 teilnehmenden Krankenhäusern sowie 13.000 erweiterten Pflegeorganisationen. 
Das Unternehmen ging 1999 an die NASDAQ und ist unter dem Tickersymbol zu finden: MDRX
Im Jahr 2008 fusionierte das Unternehmen mit dem Wettbewerber Misys. Im Jahr 2010 fusionierte Allscripts-Misys mit Eclypsys.
Im Jahr 2012 trat der Gründer und CEO Glen Tullman von seinem Posten zurück und verließ das Unternehmen. Paul Black übernahm den Posten des CEO des kontinuierlich wachsenden Unternehmens. 
Im März 2013 erwarb Allscripts dbMotion, einen Anbieter von Lösungen für das kommunale Gesundheitswesen, und Jardogs LLC, einen Anbieter von Lösungen für die Einbindung von Patienten.
Allscripts soll fast 9,75 Millionen US-Dollar an die vorgeschlagene Sammelklägergruppe zahlen, um Ansprüche wegen Wertpapierbetrugs beizulegen, nachdem das Unternehmen angeblich seine Fähigkeit zur Integration seiner Microsoft.NET und SQL Server mit denen von Eclipsys nach deren 1,3 Milliarden Dollar teuren Fusion zu integrieren.
Der Hauptsitz des Unternehmens befindet sich in Chicago, Illinois, mit einem Satellitenbüro in Raleigh, North Carolina.
