1000 Genomes Daten in Ensembl
Ensembl bietet einen Genom-Browser, in dem die Daten des 1000 Genomes Project zusammen mit einer breiten Palette zusätzlicher Datenquellen betrachtet werden können, sowie Zugang zu Werkzeugen, die für die Arbeit mit den 1000 Genomes Daten und anderen Datensätzen verwendet werden können.
In Ensembl können die Daten entweder auf dem Referenzassembly GRCh37 (das in der letzten Phase des 1000 Genomes Project verwendet wurde) oder auf dem aktuellen Referenzgenom GRCh38 angezeigt werden.
- Ensembl GRCh37 – Anzeige der Daten des 1000 Genomes Project auf dem vom Projekt verwendeten Referenzgenom
- Ensembl GRCh38 – Anzeige der Daten des 1000 Genomes Project auf dem aktuellen menschlichen Referenzgenom
Während des 1000 Genomes Project wurden die Daten so bald wie möglich über Early-Access-Browser für jede der Datenproduktionsphasen des Projekts freigegeben. Diese wurden erstellt, um das Durchsuchen zu ermöglichen, bevor die Daten in Ensembl verfügbar waren, und wurden nun eingestellt. Wenn Sie Fragen dazu haben, wenden Sie sich bitte an [email protected].
Tutorials und Leitfäden
Es gibt Tipps für Ensembl sowohl auf der Ensembl-Hauptseite als auch in ihrem Blog.
Das NCBI bietet auch einen 1000-Genome-Browser auf seiner Website an.