RasGEF-Domäne ist eine Domäne in der CDC25-Familie von Guanin-Nukleotid-Austauschfaktoren für Ras-ähnliche kleine GTPasen.
RasGEF-Domäne | |||||||
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Struktur von menschlichem H-Ras.
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Bezeichner | |||||||
Symbol | RasGEF | ||||||
Pfam | PF00617 | ||||||
InterPro | IPR001895 | ||||||
SMART | RasGEF | ||||||
PROSITE | PDOC00594 | ||||||
SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
OPM Protein | 1xd4 | ||||||
CDD | cd00155 | ||||||
Verfügbare Proteinstrukturen: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB |
Ras-Proteine sind membranassoziierte molekulare Schalter, die GTP und GDP binden und GTP langsam zu GDP hydrolysieren. Das Gleichgewicht zwischen dem GTP-gebundenen (aktiven) und dem GDP-gebundenen (inaktiven) Zustand wird durch die entgegengesetzte Wirkung von Proteinen, die die GTPase-Aktivität aktivieren, und von Proteinen, die den Verlust von gebundenem GDP und die Aufnahme von frischem GTP fördern, geregelt. Letztere Proteine werden als Guanin-Nukleotid-Dissoziationsstimulatoren (GDS) (oder auch als Guanin-Nukleotid-Freisetzungs- (oder Austausch-) Faktoren (GRF)) bezeichnet. Proteine, die als GDS fungieren, können auf der Grundlage von Sequenzähnlichkeiten in mindestens zwei Familien eingeteilt werden, die CDC24-Familie (siehe InterPro: IPR001331) und die CDC25-Familie (RasGEF).
Die Größe der Proteine der CDC25-Familie reicht von 309 Resten (LTE1) bis 1596 Resten (sos). Die Sequenzähnlichkeit all dieser Proteine beschränkt sich auf eine Region von etwa 250 Aminosäuren, die sich im Allgemeinen in ihrem C-terminalen Abschnitt befindet (die einzigen Ausnahmen sind derzeit sos und ralGDS, wo diese Domäne den zentralen Teil des Proteins ausmacht). Diese Domäne hat sich bei CDC25 und SCD25 als wesentlich für die Aktivität dieser Proteine erwiesen.