Fall 1
Ein Patient mit Speiseröhrenkrebs, bei dem eine S. haliotis diagnostiziert wurde.
Ein 68-jähriger männlicher Patient wurde am 24. Juli 2016 in das Volkskrankenhaus der Stadt Liaocheng, China, eingeliefert, weil er „4 Stunden lang hämatemesis“ hatte. Bei ihm war vor mehr als 2 Jahren Speiseröhrenkrebs diagnostiziert worden. Bei der Aufnahme wurden eine Körpertemperatur von 36,3 °C, eine Pulsfrequenz von 92 Schlägen/min, eine Atmung von 22 Mal/min und ein Blutdruck von 135/80 mmHg gemessen. Nicht tastbare Vergrößerung der beidseitigen Hals- und supraklavikulären Lymphknoten, Luftröhre in der Mitte, pektorale Symmetrie, sichtbare Narben in der rechten Brust, deutliches Perkussionsgeräusch an der doppelten Lunge, Auskultation eines groben Atemgeräusches, keine trockenen und feuchten Rasselgeräusche, regelmäßiger Rhythmus, Perkussion ohne Schmerzen in der Nierengegend, negativ auf Verschiebungsdämpfung und Darmgeräusche von 3 mal/min. Seine Einweisungsdiagnose lautete Speiseröhrenkrebs nach Operation und Bluthochdruck. Bei der Aufnahme wurden die Zusatzuntersuchungen durchgeführt, um die Ursache der Hämatemesis zu ermitteln. Es wurde eine schmerzlose Gastroskopie durchgeführt, bei der jedoch keine offensichtlichen Abnormalitäten festgestellt wurden. Die schmerzlose bronchoskopische Untersuchung ergab eine Blutung im hinteren Basalsegment des linken Unterlappens. Die Bürstenpathologie ergab keine offensichtlichen Tumorzellen. Die Thorax- und Abdominal-Computertomographie zeigte, dass er eine Speiseröhrenoperation, eine Bronchitis und ein Emphysem, Knötchen im mittleren Lappen der rechten Lunge, interstitielle Läsionen im rechten Ober- und linken Unterlappen und eine Entzündung im unteren Lappen der linken Lunge hatte. Er erhielt ein Medikament (3 g Cefoperazon/Sulbactam zweimal täglich für 6 Tage) und eine Therapie zur Krebsbekämpfung, Entzündungshemmung, Rehydrierung und Blutstillung. Nach sechstägiger Behandlung besserten sich seine Symptome, und der Patient wurde aus dem Krankenhaus entlassen.
Die bronchoalveoläre Lavageflüssigkeit (BALF) wurde entnommen, als er eine schmerzfreie bronchoskopische Untersuchung erhielt und die Zellzahl über 104 cfu/ml lag. Die Probe wurde zur Anzucht von Bakterienkulturen auf Blutagarmedium streifeninokuliert. Stämme mit unterschiedlichen phänotypischen Merkmalen auf Blutagar wurden isoliert und mit dem VITEK 2 System unter Verwendung der ID-GN Karte (boiMérieux) als S. algae, Escherichia coli und Klebsiella pneumoniae identifiziert. Da nur zwei Shewanella-Arten, S. putrefaciens und S. algae, in der Datenbank des VITEK 2 Systems registriert waren, wurde die 16S rRNA-Gensequenz durch eine zuvor beschriebene PCR amplifiziert. Das PCR-Produkt wurde sequenziert, und die Nukleotidsequenz wurde bei GenBank unter der Zugangsnummer MF589233 hinterlegt. Eine BLAST-Analyse der 16S rRNA-Gensequenz in GenBank ergab eine Ähnlichkeit von 99,0 % mit dem Typstamm von S. haliotis DW01 (Hinterlegungsnummer NR_117770.1). Weitere phylogenetische Analysen mit allen in der GenBank-Datenbank verfügbaren Typsequenzen von Shewanella-Arten bestätigten, dass der Stamm als Spezies von S. haliotis identifiziert wurde (LC2016-1 in Abb. 1).
Phylogenetischer Baum, konstruiert durch die Nachbarschaftsverbindungsmethode, basierend auf den Nukleotidsequenzen des 16S rRNA-Gens. Der phylogenetische Baum wurde aus einem Alignment von 1427 nt konstruiert, und alle bekannten Typstämme der Shewanella-Arten wurden einbezogen. Die Zahlen an den Knotenpunkten geben die Bootstrap-Werte an (Prozentsatz von 1000 Wiederholungen). Balken, 10 Substitutionen pro Nukleotidposition. Die fettgedruckte Schrift zeigt die Stämme aus Fall I und II an. Die GenBank-Zugangsnummern der 16S rRNA-Gensequenzen standen in Klammern. Das schwarze Dreieck bestand aus vierundfünfzig Shewanella-Arten. Die Namen der Spezies und die GenBank-Zugangsnummern der 16S rRNA-Gensequenzen sind in Additional file 1: Table S1
Um die Zusammensetzung und den Reichtum der bakteriellen Gemeinschaft in der BALF weiter zu bestätigen, wurde die Probe einer 16S rRNA-Amplikon-Sequenzierung unterzogen. Das Ergebnis zeigte, dass die Zusammensetzung der Bakteriengemeinschaft u.a. die Gattungen Shewanella (88,34%), Escherichia (11,11%) und Streptococcus (0,38%) umfasste, wobei die Mehrheit der Gattungen Shewanella war.
Die Antibiotika-Empfindlichkeitsprüfung wurde mit der Mikrodilutionsmethode in Mueller-Hinton-Bouillon durchgeführt. Der Stamm war empfindlich gegenüber Piperacillin/Tazobactam (minimale Hemmkonzentration, MIC: 8 μg/ml), Ceftazidim (1 μg/ml), Cefepim (1 μg/ml), Amikacin (2 μg/ml), Gentamicin (1 μg/ml), Imipenem (4 μg/ml), Meropenem (4 μg/ml), war aber resistent gegenüber Ciprofloxacin (8 μg/ml) und Levofloxacin (8 μg/ml).
Fall 2
Ein Patient mit Magenkrebs, bei dem eine S.-Algen-Bakteriämie diagnostiziert wurde.
Ein 56-jähriger Mann wurde am 6. Oktober 2016 in das Volkskrankenhaus der Stadt Liaocheng, China, eingeliefert, weil er „seit einem Monat Oberbauchschmerzen“ hatte. Die körperliche Untersuchung bei der Aufnahme ergab eine Körpertemperatur von 36,1 Grad, eine Pulsfrequenz von 72 Schlägen/min, eine Atmung von 18 Mal/min und einen Blutdruck von 140/90 mmHg. Es wurden nicht tastbare Vergrößerungen der beidseitigen Hals- und supraklavikulären Lymphknoten, ein flaches Abdomen, keine gastrointestinalen oder peristaltischen Wellen festgestellt. Es wurden weiche Bauchmuskeln, leichte Empfindlichkeit im Oberbauch und keine offensichtlichen Rebound-Schmerzen festgestellt. Seine Leber und Milz berührten sich nicht unter der Rippe, und es wurde keine tastbare Masse entdeckt. Bei der Rektaluntersuchung wurden keine abnormen Darmgeräusche und keine Abnormitäten festgestellt. Das Gastroskop zeigte sichtbare Ulkusläsionen am Herzen, die den Magenfundus und den Magenkörper betrafen. Die pathologischen Ergebnisse wiesen auf ein Adenokarzinom hin. Seine Aufnahmediagnosen waren Magenkrebs und Bluthochdruck.
Bei der Aufnahme wurden am 9. Oktober 2016 die Zusatzuntersuchungen durchgeführt. Die Laparoskopie ergab, dass er sich in einem späten Tumorstadium ohne radikale Resektion befand. Daraufhin erhielt er eine intravenöse und intraperitoneale Chemotherapie, gefolgt von einer schweren Knochenmarksuppression, bei der die Blutzellen und Blutplättchen deutlich unter dem Normalwert lagen. Er erhielt eine weitere Behandlung zur Bekämpfung von Infektionen, Ernährungsunterstützung, Rehydrierung, Stimulierung der Granulopoese und symptomatische Behandlung. Am 26. Oktober 2016 hatte der Patient Kurzatmigkeit, Herzfrequenz und andere Symptome mit rauen Lungengeräuschen, keine Rasselgeräusche und kalte Gliedmaßen. Es wurde angenommen, dass ein septischer Schock vorlag. Er erhielt nicht-invasive mechanische Beatmung und Flüssigkeitsausdehnung, Kolloid, Bluttransfusionsprodukte, Anti-Infektionsmittel (1 g Imipenem wurde alle 8 Stunden für 7 Tage verabreicht), Aufrechterhaltung des Kreislaufs, Säuresuppression, Leberschutz, Ernährungsunterstützung, Aufrechterhaltung des Wasser- und Elektrolyt-Säure-Basen-Gleichgewichts, Überwachung des Blutdrucks, der Herzfrequenz, der Atmungsfunktion, des stündlichen Urinvolumens und der Blutung. Der Patient hatte eine schwere Infektion und das Vorhandensein eines Syndroms multipler Organdysfunktionen (Atmung, Kreislauf, Magen-Darm-Trakt, Blut und Nieren). Der Patient und seine Familienangehörigen verlangten die automatische Entlassung in ein Hospiz. Seine Entlassungsdiagnosen waren multiples Organfunktionssyndrom (Atmung, Kreislauf, Magen-Darm, Blut und Niere), Magenkrebs und Bluthochdruck.
Nach dem Auftreten eines septischen Schocks wurde eine Blutkultur entnommen, um die Bakterien zu trennen. Das mikrobielle Wachstum wurde sowohl in anaeroben als auch in aeroben Flaschen nachgewiesen, und die positiv gemeldete Zeit betrug 8,1 bzw. 11,9 Stunden. In beiden Flaschen wurde ein einheitlicher gramnegativer Bazillus nachgewiesen. Nach 24 Stunden Inkubation wuchsen hämolytische, oxidase-positive gelbe Kolonien auf Blutagar. Der Stamm wurde mit dem VITEK 2 System unter Verwendung der ID-GN-Karte (boiMérieux) als S. putrefaciens identifiziert. Die 16S rRNA-Gensequenz des Stammes wurde bei GenBank hinterlegt (Hinterlegungsnummer: MF589234). Eine BLAST-Analyse bei GenBank ergab eine Ähnlichkeit von 100,0 % mit dem S. upenei-Stamm VITVAGJ (Hinterlegungsnummer KP090164.1). Eine weitere phylogenetische Analyse mit allen in der GenBank-Datenbank verfügbaren Typsequenzen von Shewanella-Arten bestätigte die Zugehörigkeit des Stammes zur Art S. upenei (LC2016-5 in Abb. 1). Am Tag der Blutentnahme wurde auch seine Peritonealdrainageflüssigkeit entnommen und mit denselben Identifizierungsmethoden kultiviert, und die Ergebnisse der bakteriellen Identifizierung und der Medikamentenempfindlichkeit stimmten mit denen des Blutes überein.
Die Antibiotika-Empfindlichkeitsprüfung wurde mit der Mikrodilutionsmethode in Mueller-Hinton-Bouillon durchgeführt. Der Stamm war empfindlich gegenüber Aztreonam (1 μg/ml), Ceftazidim (1 μg/ml), Cefepim (1 μg/ml), Amikacin (2 μg/ml), Gentamicin (1 μg/ml) und Levofloxacin (1 μg/ml), lag aber zwischen Imipenem (8 μg/ml), Piperacillin/Tazobactam (64 μg/ml) und Ciprofloxacin (2 μg/ml).