Nova ha sido criticada por no evaluar siempre a los autores mediante el proceso de revisión por pares académicos y por volver a publicar a precios elevados capítulos de libros antiguos de dominio público e informes gubernamentales de libre acceso. Estas críticas llevaron al bibliotecario Jeffrey Beall a escribir que, en su opinión, Nova Science Publishers se encontraba en el «nivel más bajo» de las editoriales.
Una encuesta reciente de bases de datos nacionales e internacionales de editoriales de libros académicos (incluyendo el Book Citation Index, Scopus, CRIStin, JUFO, VIRTA y SPI) identificó a Nova como uno de los «núcleos de editoriales que están indexados en los cinco» de los sistemas de información encuestados. Este «núcleo» contenía 46 de las 3.765 editoriales identificadas.
En un informe de 2011 sobre veintiuna editoriales internacionales de libros de ciencias sociales que determinaba la penetración en los mercados internacionales y la mención de los libros en los sistemas de índices científicos internacionales como Cambridge Scientific Abstracts, Nova Science Publishers ocupaba el puesto 17 de 21. En un estudio de clasificación de editoriales de libros de 2017, Nova Science Publishers ocupó un lugar destacado en cuanto al número de libros publicados, pero cerca de la parte inferior en cuanto al número de menciones por libro. Un informe de 2018 del mismo autor indica ahora que Nova se sitúa entre la mitad superior de las 51 en cuanto a 1.posición global de la empresa; 2.empresa como factor en el mercado; 3.impacto de la empresa en el debate político y económico mundial; 4.distribución con éxito de best-sellers; 5.impacto en la comunidad académica; 6.distribución con éxito de la producción a más de 50 bibliotecas Worldcat mundiales; 7.producción durante los últimos 5 años; 8.calidad académica destacada. Pero además, a partir de 2018, Nova ha sido eliminada de la lista noruega de canales de publicación científica aprobados (Norwegian Register for Scientific Journals, Series and Publishers).