8. lokakuuta 2010 Nicaraguan hallitus aloitti komentaja Edén Pastoran johdolla operaatiot 33 kilometrin pituisen San Juan -joen ruoppaamiseksi. Lokakuun 20. päivänä Costa Rican hallitus valitti Nicaraguan viranomaisille väitetystä suvereniteetin loukkauksesta, koska nicaragualaiset joukot olivat tunkeutuneet Costa Rican alueelle. Costa Rican hallituksen mukaan joen ruoppaaminen aiheutti ympäristövahinkoja saaren luonnonsuojelualueeseen kuuluvalla Isla Caleron kosteikolla Costa Rican ympäristöministeriön omistamalla alueella. Nicaragua torjui kaikki väitteet ja vastasi, että itse asiassa costa-ricolaiset olivat tunkeutuneet sen alueelle, ja Nicaraguan varapresidentti kommentoi, että ”emme voi tunkeutua omalle alueellemme”. Costa Rican hallitus vastasi lähettämällä 70 poliisivahvistusta raja-alueelle 22. lokakuuta. Nicaragua sijoitti saarelle noin 50 sotilasta.
Costaricalaisen sanomalehden mukaan Edén Pastora perusteli toimiaan Google Mapsin osoittamalla rajalla ja tarpeella torjua huumekauppaa. Pastora kuitenkin kiisti esittäneensä väitteitä siitä, että olisi tukeutunut Google Mapsiin rajan määrittelyssä, ja sanoi nicaragualaiselle lehdistölle, että hänen käsityksensä rajasta perustui vuoden 1858 Cañas-Jerezin sopimuksen alkuperäiseen tekstiin. Googlen Latinalaisen Amerikan edustaja totesi, että vaikka ”Googlen kartat ovat erittäin korkealaatuisia ja Google työskentelee jatkuvasti parantaakseen ja päivittääkseen olemassa olevaa tietoa, niitä ei missään nimessä pitäisi käyttää viitteenä kahden maan välisistä sotatoimista päätettäessä”. Hän lisäsi: ”Tässä tapauksessa Google on todennut, että Costa Rican ja Nicaraguan välisen rajan muotoilussa oli epätarkkuutta, ja se pyrkii päivittämään tiedot mahdollisimman nopeasti.” Myöhemmin Google korjasi rajakuvauksen Google Earthissa ja Google Mapsissa.
Kumpikin maa otti erilaisia lähestymistapoja asian ratkaisemiseen. Nicaragua väitti, että kyseessä oli rajakiista, joka pitäisi ratkaista kansainvälisessä tuomioistuimessa, kun taas Costa Rica väitti, että kyseessä oli sotilaallinen tunkeutuminen ja että Amerikan valtioiden järjestön (OAS) pitäisi ratkaista asia.
OAS:n pääsihteeri José Miguel Insulza tapasi molemmat hallitukset ja tutki konfliktialueen. Sen jälkeen hän kehotti molempia maita poistamaan kaikki joukot ja turvallisuushenkilöstön kiistanalaiselta alueelta ensimmäisenä askeleena kohti vuoropuhelun aloittamista tilanteen ratkaisemiseksi rauhanomaisesti ja rajan rajaamiseksi uusien konfliktien estämiseksi. Costa Rica suostui näihin ehtoihin, mutta Nicaragua kieltäytyi poistamasta joukkojaan. Marraskuun 12. päivänä pidetyssä kokouksessa OAS:n suurlähettiläät hyväksyivät äänin 22-2 päätöslauselman, jossa Costa Ricaa ja Nicaraguaa pyydettiin vetämään joukkonsa pois niiden yhteisellä rajalla sijaitsevalta konfliktialueelta ja käymään neuvotteluja kiistansa ratkaisemiseksi. Nicaraguan presidentti Daniel Ortega hylkäsi mahdollisuuden vetää joukot pois ja sivuutti OAS:n päätöslauselman, koska hänen hallituksensa katsoi, ettei järjestöllä ole toimivaltaa ratkaista rajakiistoja. Samassa lehdistötilaisuudessa presidentti Ortega ilmoitti aikovansa nostaa kanteen kansainvälisessä tuomioistuimessa saadakseen luvan liikennöidä Costa Rican Colorado-joella.
Poliittisella puolella jotkut kommentaattorit kritisoivat Daniel Ortegaa siitä, että hän väitetysti käytti tätä asiaa hyväkseen edistääkseen uudelleenvalintaansa. Entinen presidentti Óscar Arias arvosteli Costa Rican presidenttiä Laura Chinchillaa tilanteen naiivista käsittelystä.
18. marraskuuta 2010 Costa Rica nosti kanteen Nicaraguaa vastaan kansainvälisessä tuomioistuimessa. Kanteessa väitettiin Nicaraguan armeijan tunkeutuneen Costa Rican alueelle, miehittäneen sitä ja käyttäneen sitä, rikkoneen Nicaraguan sopimusvelvoitteita Costa Ricaa kohtaan sekä ”meneillään olevia ja suunniteltuja ruoppauksia ja kanavan rakentamista, (jotka) vaikuttavat vakavasti veden virtaukseen Costa Rican Colorado-jokeen ja aiheuttavat lisävahinkoja Costa Rican alueelle, mukaan lukien alueella sijaitseville kosteikoille ja kansallisille luonnonsuojelualueille”. Costa Rica esitti myös pyynnön väliaikaisista toimenpiteistä, mukaan lukien kaikkien Nicaraguan joukkojen vetäminen pois saarelta, kanavan rakentamisen lopettaminen Costa Rican alueen poikki, sedimenttien läjittämisen välitön lopettaminen Costa Rican alueelle sekä puiden kaatamisen, kasvillisuuden ja maaperän poistamisen välitön lopettaminen Costa Rican alueelta, mukaan lukien sen kosteikot ja metsät. Samana päivänä OAS hyväksyi äänin 22-1 (7 tyhjää) Costa Rican pyynnön kutsua koolle OAS:n ulkoministerien neuvoa-antava kokous analysoimaan Costa Rican ja Nicaraguan välistä tilannetta San Juan -joen rajavyöhykkeellä. Kokous pidettiin 7. joulukuuta 2010.
Maaliskuussa 2011 kansainvälinen tuomioistuin päätti väliaikaisesti, että Costa Rican ja Nicaraguan on molempien pidättäydyttävä lähettämästä tai pitämästä yllä siviilejä, turvallisuusjoukkoja tai poliiseja tälle kiistanalaiselle raja-alueelle, mutta Costa Rica sai lähettää sinne siviiliryhmiä, jotka käsittelevät ympäristöasioita. Nicaraguan ruoppaustyöt itse San Juan -joella saivat jatkua, koska Nicaragua hallitsee itse jokea.
Myöhemmin syntyi kiista Costa Rican Nicaraguan rajalle rakentamasta tiestä. Nicaragua väitti, että kosteikkoja ja kansallispuistoja vahingoitettiin. Costa Rica kuitenkin väitti, että tie oli välttämätön suojaksi ”sandinisteilta” ja sähkön ja muiden tarpeiden tarjoamiseksi syrjäisellä paikalla asuville ihmisille, joille ainoa aiempi kauttakulkutapa oli kulkea veneellä San Juan -jokea pitkin.
Tarkennus: konflikti ei tapahdu Isla Calerolla, jossa 151.6 km2 , vaan Isla Portillos -saarella (joka sijaitsee Caleron pohjoispuolella), joka on Costa Rican kahdeksanneksi suurin saari (16,8 km2 ), mukaan lukien Refugio Nacional de Vida Silvestre Corredor Fronterizo Norte , 18. toukokuuta 1994 annetun toimeenpanevan asetuksen nro 23248-MIRENEN mukaan. Nicaragualaiset ja costa-ricolaiset, myös molempien maiden lehdistö ja hallitukset, ovat sekoittaneet Isla Portillosin isoon Isla Caleroon. Tästä huolimatta konflikti on tullut tunnetuksi nimellä ”Caleron saaren konflikti”.