RasGEF-domeeni on domeeni, joka löytyy Rasin kaltaisten pienten GTPaasien guaniininukleotidinvaihtotekijöiden CDC25-perheestä.
| RasGEF-domeeni | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
Henkilön H-Ras-ras-rakenne.
|
|||||||
| Tunnisteet | |||||||
| Symboli | RasGEF | ||||||
| Pfam | PF00617 | ||||||
| InterPro | IPR001895 | ||||||
| SMART | RasGEF | ||||||
| PROSITE | PDOC00594 | ||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM proteiini | 1xd4 | ||||||
| CDD | cd00155 | ||||||
| Saatavilla olevat proteiinirakenteet: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | |||
Ras-proteiinit ovat kalvoassosioituneita molekyylikytkimiä, jotka sitovat GTP:tä ja GDP:tä ja hydrolysoivat hitaasti GTP:tä GDP:ksi. Tasapainoa GTP:hen sidotun (aktiivisen) ja GDP:hen sidotun (inaktiivisen) tilan välillä säätelevät GTPaasiaktiivisuutta aktivoivien proteiinien ja sidotun GDP:n häviämistä ja tuoreen GTP:n ottoa edistävien proteiinien vastakkaiset vaikutukset. Viimeksi mainittuja proteiineja kutsutaan guaniininukleotidien dissosiaation stimulaattoreiksi (GDS) (tai myös guaniininukleotideja vapauttaviksi (tai vaihtaviksi) tekijöiksi (GRF)). GDS:nä toimivat proteiinit voidaan sekvenssiyhtäläisyyksien perusteella luokitella ainakin kahteen perheeseen, CDC24-perheeseen (ks. InterPro: IPR001331) ja tähän CDC25-perheeseen (RasGEF).
CDC25-perheeseen kuuluvien proteiinien koko vaihtelee 309:stä jäämästä (LTE1) 1596:een jäämään (sos). Kaikkien näiden proteiinien yhteinen sekvenssin samankaltaisuus rajoittuu noin 250 aminohapon alueeseen, joka sijaitsee yleensä niiden C-terminaalisessa osassa (tällä hetkellä ainoat poikkeukset ovat sos ja ralGDS, joissa tämä alue muodostaa proteiinin keskiosan). Tämän domeenin on osoitettu CDC25:ssä ja SCD25:ssä olevan välttämätön näiden proteiinien aktiivisuuden kannalta.