Allscripts Healthcare Solutions, communément appelée simplement Allscripts, a été fondée à l’origine en 1982 sous le nom de Medic Computer Systems par Glen Tullman. Le nom a été modifié en 1986 pour devenir Allscripts.
L’entreprise fournit aux médecins en cabinet privé, aux hôpitaux et aux autres prestataires de soins de santé similaires des technologies de gestion des cabinets et des ERH (dossiers médicaux électroniques). Allscripts fournit également des solutions pour l’engagement des patients et la coordination des soins, ainsi qu’une technologie financière et analytique.
À l’heure actuelle, la société compte plus de 180 000 utilisateurs médecins et dispose de solutions dans 2 700 hôpitaux participants, ainsi que dans 13 000 organisations de soins prolongés. 
La société est devenue publique sur le NASDAQ en 1999 et peut être trouvée sous le symbole ticker : MDRX
En 2008, la société a fusionné avec son concurrent Misys. En 2010, Allscripts-Misys a fusionné avec Eclypsys.
En 2012, le fondateur et PDG Glen Tullman s’est retiré de son poste et a quitté l’entreprise. Paul Black a pris la relève en tant que PDG de cette entreprise en croissance continue. 
En mars 2013, Allscripts a fait l’acquisition de dbMotion, un fournisseur de solutions de santé communautaire et de Jardogs LLC, un fournisseur de solutions d’engagement des patients.
Allscripts doit payer près de 9,75 millions de dollars au groupe proposé pour régler les réclamations de fraude sur les valeurs mobilières après que la société aurait surestimé sa capacité à intégrer ses serveurs Microsoft.NET et SQL Server avec ceux d’Eclipsys après leur fusion de 1,3 milliard de dollars.
Le siège social de la société est situé à Chicago, dans l’Illinois, avec un bureau satellite à Raleigh, en Caroline du Nord.
