Le domaine RasGEF est un domaine présent dans la famille CDC25 des facteurs d’échange de guanine nucléotide pour les petites GTPases de type Ras.
| Domaine RasGEF | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
Structure de H-Ras humain.
|
|||||||
| Identificateurs | |||||||
| Symbole | RasGEF | ||||||
| Pfam | PF00617 | ||||||
| InterPro | IPR001895 | ||||||
| SMART | RasGEF | ||||||
| PROSITE | PDOC00594 | ||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM protéine | 1xd4 | ||||||
| CDD | cd00155 | ||||||
| Structures de protéines disponibles : | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | |||
Les protéines Ras sont des commutateurs moléculaires associés à la membrane qui lient le GTP et le GDP et hydrolysent lentement le GTP en GDP. L’équilibre entre les états lié au GTP (actif) et lié au PIB (inactif) est régulé par l’action opposée des protéines activant l’activité de la GTPase et celle des protéines qui favorisent la perte du PIB lié et l’absorption de GTP frais. Ces dernières protéines sont connues sous le nom de stimulateurs de dissociation des guanine-nucléotides (GDS) (ou également sous le nom de facteurs de libération (ou d’échange) des guanine-nucléotides (GRF)). Les protéines qui agissent comme GDS peuvent être classées en au moins deux familles, sur la base des similitudes de séquence, la famille CDC24 (voir InterPro : IPR001331) et cette famille CDC25 (RasGEF).
La taille des protéines de la famille CDC25 varie de 309 résidus (LTE1) à 1596 résidus (sos). La similarité de séquence partagée par toutes ces protéines est limitée à une région d’environ 250 acides aminés généralement située dans leur partie C-terminale (actuellement les seules exceptions sont sos et ralGDS où ce domaine constitue la partie centrale de la protéine). Ce domaine s’est avéré, chez CDC25 et SCD25, être essentiel pour l’activité de ces protéines.