Les données de 1000 génomes dans Ensembl
Ensembl fournit un navigateur de génome où les données du projet 1000 génomes peuvent être visualisées aux côtés d’un large éventail de sources de données supplémentaires, tout en donnant accès à des outils qui peuvent être utilisés pour travailler avec les données de 1000 génomes et d’autres ensembles de données.
Dans Ensembl, les données peuvent être visualisées soit sur l’assemblage de référence GRCh37 (utilisé par la phase finale du projet 1000 Génomes), soit sur le génome de référence actuel, GRCh38.
- Ensembl GRCh37 – visualiser les données du projet 1000 génomes sur le génome de référence utilisé par le projet
- Ensembl GRCh38 – visualiser les données du projet 1000 génomes sur le génome de référence humain actuel
Pendant le projet 1000 génomes, les données ont été partagées dès que possible via des navigateurs d’accès anticipé pour chacune des phases de production de données du projet. Ceux-ci ont été créés pour permettre la navigation avant que les données ne soient disponibles dans Ensembl et ont maintenant été retirés. Si vous avez des questions à ce sujet, veuillez contacter [email protected].
Tutoriels et guides
Il existe des conseils pour Ensembl à la fois sur le site principal d’Ensembl et sur leur blog.
Le NCBI fournit également un navigateur 1000 génomes hébergé sur leur site.