2010. október 8-án a nicaraguai kormány Edén Pastora parancsnok vezetésével megkezdte a San Juan folyó 33 kilométeres szakaszának kotrását. Október 20-án a Costa Rica-i kormány panaszt tett a nicaraguai hatóságoknál szuverenitásának állítólagos megsértése miatt, mivel a nicaraguai csapatok Costa Rica területére léptek. A Costa Rica-i kormány szerint a folyó kotrása környezeti károkat okozott a sziget természetvédelmi területéhez tartozó Isla Calero sziget vizes élőhelyén, egy olyan területen, amely a Costa Rica-i Környezetvédelmi Minisztérium tulajdonában van. Nicaragua visszautasított minden állítást, és azt válaszolta, hogy valójában a Costa Rica-iak behatoltak a területére, és Nicaragua alelnöke megjegyezte, hogy “nem hatolhatunk be a saját területünkre”. A Costa Rica-i kormány válaszul október 22-én 70 rendőrségi erősítést küldött a határvidékre. Nicaragua mintegy 50 katonát állomásoztatott a szigeten.
Egy Costa Rica-i újság szerint Edén Pastora a Google Maps által mutatott határral és a kábítószer-kereskedelem elleni küzdelem szükségességével indokolta az intézkedését. Pastora azonban tagadta, hogy a Google Mapsre támaszkodott volna a határ meghatározásakor, és a nicaraguai sajtónak azt nyilatkozta, hogy a határról alkotott felfogása az 1858-as Cañas-Jerez szerződés eredeti szövegén alapul. A Google Latin-Amerika képviselője kijelentette, hogy bár “a Google-térképek nagyon jó minőségűek, és a Google folyamatosan dolgozik a meglévő információk javításán és frissítésén, semmiképpen sem szabad hivatkozási alapként használni őket két ország közötti katonai akciók eldöntéséhez”. Hozzátette: “Ebben az esetben a Google megállapította, hogy pontatlanság történt a Costa Rica és Nicaragua közötti határ kialakításában, és azon dolgozik, hogy az információkat a lehető leggyorsabban frissítse”. A határ ábrázolását a Google később korrigálta a Google Earth-ben és a Google Maps-ben.
A két ország különböző megközelítést alkalmazott a probléma megoldására. Nicaragua azzal érvelt, hogy határvitáról van szó, amelyet a Nemzetközi Bíróságnak kellene megoldania, míg Costa Rica azt állította, hogy katonai behatolásról van szó, és az Amerikai Államok Szervezetének (OAS) kellene megoldania a kérdést.
Az OAS főtitkára, José Miguel Insulza találkozott mindkét kormánnyal, és megtekintette a konfliktus helyszínét. Ezután felszólította mindkét országot, hogy vonják ki az összes csapatot és biztonsági személyzetet a vitatott területről, első lépésként a helyzet békés megoldását célzó párbeszéd megkezdéséhez és a határvonal kijelöléséhez a további konfliktusok megelőzése érdekében. Costa Rica beleegyezett ezekbe a feltételekbe, de Nicaragua nem volt hajlandó kivonni csapatait. November 12-i ülésükön az OAS nagykövetei 22 szavazattal 2 ellenében elfogadtak egy határozatot, amelyben felkérték Costa Ricát és Nicaraguát, hogy vonják ki csapataikat a közös határuk mentén lévő konfliktusövezetből, és folytassanak tárgyalásokat a vitájuk rendezéséről. Daniel Ortega nicaraguai elnök elvetette a csapatkivonás lehetőségét, és figyelmen kívül hagyta az OAS határozatát, mert kormánya úgy vélte, hogy ez a szervezet nem rendelkezik hatáskörrel a határviták rendezésére. Ugyanezen a sajtótájékoztatón Ortega elnök bejelentette azon szándékát, hogy keresetet nyújt be a Nemzetközi Bírósághoz a Costa Rica-i Colorado folyón való hajózás engedélyezése érdekében.
A politikai oldalon egyes kommentátorok bírálták Daniel Ortegát, amiért állítólag kihasználta ezt az ügyet újraválasztásának elősegítésére. Laura Chinchilla Costa Rica-i elnököt Óscar Arias volt elnök bírálta a helyzet naiv kezelése miatt.
2010. november 18-án Costa Rica eljárást indított Nicaragua ellen a Nemzetközi Bíróságon. A panaszban azt állították, hogy Nicaragua hadserege behatolt Costa Rica területére, megszállta és használta azt, megszegte Nicaragua Costa Ricával szembeni szerződéses kötelezettségeit, valamint “a folyamatban lévő és tervezett kotrás és a csatorna építése (amely) súlyosan befolyásolja a Costa Rica-i Colorado folyó vízhozamát, és további károkat fog okozni Costa Rica területén, beleértve a térségben található vizes élőhelyeket és nemzeti természetvédelmi területeket”. Costa Rica ideiglenes intézkedések meghozatalát is kérte, beleértve az összes nicaraguai csapat kivonását a szigetről, a Costa Rica területén átívelő csatorna építésének leállítását, az üledék Costa Rica területén történő lerakásának azonnali leállítását, valamint a fák kivágásának, a növényzet és a talaj eltávolításának azonnali leállítását Costa Rica területéről, beleértve annak vizes élőhelyeit és erdeit. Ugyanezen a napon az OAS 22 szavazattal 1 ellenében (7 tartózkodás mellett) jóváhagyta Costa Rica kérését, hogy hívják össze az OAS külügyminisztereinek konzultatív ülését a Costa Rica és Nicaragua közötti, a San Juan folyó határövezetében kialakult helyzet elemzésére. Az ülésre 2010. december 7-én került sor.
2011 márciusában a Nemzetközi Bíróság ideiglenesen úgy döntött, hogy Costa Ricának és Nicaraguának egyaránt tartózkodnia kell attól, hogy civileket, biztonsági erőket vagy rendőrséget küldjön vagy tartson fenn ebbe a vitatott határövezetbe, de Costa Rica környezetvédelmi kérdésekkel foglalkozó civil csapatokat küldhet. A Nicaragua által a San Juan folyón belül végzett kotrás folytatódhatott, mivel Nicaragua szuverenitással rendelkezik a folyó felett.
Később vita alakult ki egy Costa Rica által a nicaraguai határon épített úttal kapcsolatban. Nicaragua azt állította, hogy vizes élőhelyeket és nemzeti parkokat károsítottak. Costa Rica mindazonáltal azzal érvelt, hogy az útra a “sandinisták” elleni védelem miatt volt szükség, valamint azért, hogy áramot és más szükségleteket biztosítson a távoli helyen élő embereknek, akik számára az egyetlen korábbi átkelési mód a San Juan folyón való csónakázás volt.
Egy tisztázó megjegyzés: a konfliktus nem a Isla Calero szigetén zajlik, a 151.6 km2 -en, hanem a Calerótól északra fekvő Isla Portillos szigeten, amely Costa Rica nyolcadik legnagyobb szigete (16,8 km2 -en), beleértve a Refugio Nacional de Vida Silvestre Corredor Fronterizo Norte-t is, az 1994. május 18-i 23248-MIRENEN számú végrehajtási rendelet szerint. Az Isla Portillost a nicaraguaiak és a Costa Rica-iak, beleértve mindkét ország sajtóját és kormányát is, összekeverik a nagyobb Isla Caleróval. Ennek ellenére a konfliktus “Calero sziget konfliktus” néven vált ismertté.