Proteinmutáció gyakorisága a rákban
A fenti “nyalókás diagram” a visszatérő (15 ráktípusból származó 4440 TCGA tumormintából legalább 3-ban megfigyelt) és ezért potenciálisan onkogén miszense mutációkat mutatja (kattintson a “Rákmutációk megjelenítése” gombra). Az alábbi oszlopdiagram a daganatminták arányát mutatja, amelyekben az adott fehérjében bármilyen módosító mutáció(k) található(ak).
Tudjon meg többet a rákos adatok PhosphoSitePlusba történő integrálásáról:
A TCGA (The Cancer Genome Atlas) 15 ráktípusból származó 4440 tumormintát integráltunk. A részletesebb mutációs információk lekérdezéséhez a cBioPortalt ajánljuk.
A következő ráktípusokat integráltuk:
– Akut myeloid leukémia (TCGA, NEJM 2013)
– Hólyag urotheliális karcinóma (TCGA, Nature 2014)
– Mell invazív karcinóma (TCGA, Cell 2015)
– Colorectalis adenokarcinóma (TCGA, Nature 2012)
– Glioblasztóma (TCGA, Cell 2013)
– Fej-nyaki laphámrák (TCGA, Nature 2015)
– Vese kromofób (TCGA, Cancer Cell 2014)
– Vese vese tiszta sejtes karcinóma (TCGA, Nature 2013)
– Tüdő adenokarcinóma (TCGA, Nature 2014)
– Tüdő laphámrák (TCGA, Nature 2012)
– Petefészek szerózus cisztadenokarcinóma (TCGA, Nature 2011)
– Papilláris pajzsmirigyrák (TCGA, Cell 2014)
– Prosztata adenokarcinóma (TCGA, Cell 2015)
– Gyomor adenokarcinóma (TCGA, Nature 2014)
– Uterus corpus endometrium karcinóma (TCGA, Nature 2013)
– Uterus corpus endometrium carcinoma (TCGA, Nature 2013)