Case 1
Egy nyelőcsőrákos beteg, akinél S. haliotis okozta tüdőgyulladás.
Egy 68 éves férfi beteget 2016. július 24-én “4 órán át tartó vérhányás” miatt vettek fel a kínai Liaocheng város népi kórházába. Több mint 2 éve diagnosztizálták nála a nyelőcsőrák műtétjét. Felvett fizikális vizsgálatai alapján testhőmérséklete 36,3 °C, pulzusszáma 92 ütés/perc, légzése 22-szer/perc, vérnyomása 135/80 mmHg volt. Kétoldali nyaki és supraclavicularis nyirokcsomók nem tapintható megnagyobbodása, légcső középen, mellkasi szimmetria, látható hegek a jobb mellkason, tiszta ütőhang a kettős tüdőnél, auskultációs durva légzéshang, száraz és nedves röhögés nem, szabályos ritmus, ütőhang nem fáj a vesetájékon, negatív a váltó tompaságra és a bélhangok 3-szor/perc. Felvételi diagnózisa nyelőcsőrák volt műtét után és magas vérnyomás. A felvételkor a hematemesis forrásának meghatározására a kiegészítő vizsgálatokat végezték. Fájdalommentes gyomortükrözést végeztek, de nyilvánvaló eltérést nem észleltek. A fájdalommentes bronchoszkópos vizsgálat a bal alsó lebeny hátsó bazális szegmensének vérzését mutatta ki. Az ecseteléses patológia nem jelzett nyilvánvaló daganatos sejteket. A mellkasi és hasi fokozott komputertomográfiás vizsgálat nyelőcsőműtétet, hörghurutot és tüdőtágulatot, a jobb tüdő középső lebenyének csomóit, a jobb felső lebeny és a bal alsó lebeny intersticiális elváltozásait, valamint a bal tüdő alsó lebenyének gyulladását mutatta ki. Gyógyszert kapott (naponta kétszer 3 g cefoperazon/sulbactamot adtak neki 6 napon keresztül), valamint rákellenes, gyulladáscsökkentő, rehidrációs és vérzéscsillapító terápiát. Hatnapos kezelés után tünetei javultak, és a beteget elbocsátották a kórházból.
A bronchoalveoláris mosófolyadékot (BALF) a fájdalommentes bronchoszkópos vizsgálat során gyűjtötték, és a sejtek száma 104 cfu/ml felett volt. A mintát csíkolták be vér-agar táptalajra baktériumtenyésztés céljából. A vérlemezeken különböző fenotípusos jellemzőkkel rendelkező törzseket izolálták és azonosították S. algae, Escherichia coli és Klebsiella pneumoniae néven a VITEK 2 rendszer segítségével az ID-GN kártya (boiMérieux) segítségével. Mivel a VITEK 2 rendszer adatbázisában csak két Shewanella faj, a S. putrefaciens és a S. algae volt regisztrálva, a 16S rRNS génszekvenciát a korábban leírt PCR segítségével amplifikáltuk . A PCR-terméket szekvenálták, és a nukleotidszekvenciát a GenBankban, az MF589233 csatlakozási szám alatt helyezték el. A 16S rRNS-gén szekvenciájának BLAST-elemzése a GenBankban 99,0%-os hasonlóságot mutatott a S. haliotis DW01 típustörzzsel (NR_117770.1 hozzáférési szám). További filogenetikai elemzés a GenBank adatbázisban elérhető összes Shewanella faj típusszekvenciájával megerősítette, hogy a törzset a S. haliotis fajként azonosították (LC2016-1 az 1. ábrán).
A 16S rRNS-gén nukleotidszekvenciái alapján a szomszéd-összekapcsolási módszerrel konstruált filogenetikai fa. A filogenetikai fát egy 1427 nt hosszúságú illesztésből építettük fel, és a Shewanella-fajok összes ismert típustörzsét felvettük. A csomópontoknál lévő számok a bootstrap-értékeket jelezték (1000 ismétlés százalékos aránya). Sáv, 10 szubsztitúció nukleotidpozíciónként. A vastag betűtípus az I. és II. eset törzseit jelölte. A 16S rRNS gén szekvenciáinak GenBank hozzáférési számai zárójelben voltak. A fekete háromszög ötvennégy Shewanella fajból állt. A fajok nevét és a 16S rRNS génszekvenciák GenBank hozzáférési számait az 1. kiegészítő fájl: S1. táblázat
A BALF baktériumközösségi összetételének és gazdagságának további megerősítésére a mintát 16S rRNS amplikon szekvenálásnak vetettük alá . Az eredmény azt mutatta, hogy a baktériumközösség összetétele többek között a Shewanella (88,34%), Escherichia (11,11%) és Streptococcus (0,38%) nemzetségeket tartalmazta, míg a legtöbb nemzetség a Shewanella volt.
Az antibiotikum-érzékenység vizsgálatát mikrohígítási módszerrel végeztük Mueller-Hinton tápoldaton. A törzs érzékeny volt a piperacillin/tazobaktámra (minimális gátló koncentráció, MIC: 8 μg/ml), ceftazidim (1 μg/ml), cefepim (1 μg/ml), amikacin (2 μg/ml), gentamicin (1 μg/ml), imipenem (4 μg/ml), meropenem (4 μg/ml), de rezisztens volt ciprofloxacinnal (8 μg/ml) és levofloxacinnal (8 μg/ml) szemben.
2. eset
Egy gyomorrákos beteg, akinél S. algae bakterémiát diagnosztizáltak.
Egy 56 éves férfi 2016. okt. 6-án került be Liaocheng város (Kína) népi kórházába “1 hónapja fennálló felső hasi fájdalom” miatt. Felvett fizikális vizsgálata 36,1 fokos testhőmérsékletet, 72 ütés/perc pulzusszámot, 18-szor/perc légzést és 140/90 mmHg vérnyomást mutatott. A kétoldali nyaki és supraclavicularis nyirokcsomók nem tapintható megnagyobbodását észlelték, a has lapos volt, gyomor-bélrendszeri vagy perisztaltikus hullámokat nem észleltek. Puha hasizmokat, enyhe érzékenységet a felső hasban és nem jelentettek nyilvánvaló visszaható fájdalmat. Mája és lépe nem érintkezett a borda alatt, és nem találtak tapintható tömeget. Negatív az eltolódó tompaság, normális bélhangok és nem észleltek kóros rektális vizsgálatot. A gyomortükrözés látható fekélyes elváltozásokra utalt a gyomorfeneket és a gyomortestet érintő kardialisnál. A patológiai eredmények adenokarcinómát jeleztek. Felvételi diagnózisa gyomorrák és magas vérnyomás volt.
A felvételkor a kiegészítő vizsgálatokat 2016. október 9-én végezték el. A laparoszkópia jelezte, hogy késői stádiumú daganatai vannak radikális reszekció nélkül. Ezt követően intravénás és intraperitoneális kemoterápiában részesült, majd súlyos csontvelő-szuppresszió következett, a vérsejtek és a vérlemezkék a normálisnál jelentősen alacsonyabbak voltak. További kezelésként fertőzésgátlást, táplálkozási támogatást, rehidrációt, a granulopoézis serkentését és tüneti kezelést kapott. 2016. október 26-án a betegnek légszomja, szívritmuszavara és egyéb tünetei voltak, a tüdő légzési hangjai érdesek voltak, és nem volt rales, a végtagok hidegek. Úgy vélték, hogy a szeptikus sokk fennállása. Nem invazív mechanikus lélegeztetést és folyadéktágítást, kolloidot, vértranszfúziós termékeket, fertőzésellenes (1 g imipenemet adtak 8 óránként 7 napig), keringés fenntartása, savszuppresszió, májvédelem, táplálkozási támogatás, víz- és elektrolit sav-bázis egyensúly fenntartása, vérnyomás, szívfrekvencia, légzésfunkció, óránként vizeletmennyiség és vérzés ellenőrzése. A betegnek súlyos fertőzése volt, és többszervi diszfunkciós szindróma (légzés, keringés, gyomor-bélrendszer, vér és vese) jelenléte. A beteg és családtagjai automatikus elbocsátást kértek hospice-ellátásra. Elbocsátási diagnózisai a következők voltak: többszervi diszfunkciós szindróma (légzés, keringés, gasztrointesztinális, vér és vese), gyomorrák és magas vérnyomás.
A szeptikus sokk megjelenése után a baktériumok elkülönítésére vérkultúrát vettek tőle. A mikrobák növekedését mind az anaerob, mind az aerob palackokban kimutatták, és a pozitív jelentési idő 8,1, illetve 11,9 óra volt. Mindkét palackból egységes Gram-negatív bacilus került elő. A 24 órás inkubációt követően hemolitikus, oxidázpozitív sárga kolóniák nőttek a véragaron. A törzset S. putrefaciens-ként azonosítottuk a VITEK 2 rendszerrel az ID-GN kártya (boiMérieux) segítségével. A törzs 16S rRNS génszekvenciáját a GenBankban helyezték letétbe (accession number: MF589234). A GenBankban végzett BLAST-elemzés 100,0%-os hasonlóságot mutatott a S. upenei VITVAGJ törzzsel (csatlakozási szám: KP090164.1). További filogenetikai elemzés a GenBank adatbázisban elérhető összes Shewanella faj típusszekvenciájával megerősítette, hogy a törzs a S. upenei fajhoz tartozik (LC2016-5 az 1. ábrán). A vérvétel napján a hashártya-drenázsfolyadékát is gyűjtötték, és ugyanazokkal az azonosítási módszerekkel tenyésztették, és a baktériumok azonosításának és gyógyszerérzékenységének eredményei megegyeztek a vérével.
Az antibiotikum-érzékenység vizsgálatát mikrohígítási módszerrel végezték Mueller-Hinton-levélen. A törzs érzékeny volt az aztreonamra (1 μg/ml), ceftazidimre (1 μg/ml), cefepimre (1 μg/ml), amikacinra (2 μg/ml), gentamicin (1 μg/ml) és levofloxacin (1 μg/ml), de az imipenem (8 μg/ml), piperacillin/tazobaktám (64 μg/ml) és ciprofloxacin (2 μg/ml) között volt.