A RasGEF domén a Ras-szerű kis GTPázok guanin nukleotid cserélő faktorainak CDC25 családjában található domén.
| RasGEF domén | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
A humán H-Ras szerkezete.
|
|||||||
| Identifiers | |||||||
| Symbol | RasGEF | ||||||
| Pfam | PF00617 | ||||||
| InterPro | IPR001895 | ||||||
| SMART | RasGEF | ||||||
| PROSITE | PDOC00594 | ||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM protein | 1xd4 | ||||||
| CDD | cd00155 | ||||||
| A rendelkezésre álló fehérjeszerkezetek: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | |||
A Ras fehérjék membrán-asszociált molekuláris kapcsolók, amelyek GTP-t és GDP-t kötnek, és a GTP-t lassan GDP-vé hidrolizálják. A GTP-hez kötött (aktív) és a GDP-hez kötött (inaktív) állapotok közötti egyensúlyt a GTPáz-aktivitást aktiváló fehérjék és a kötött GDP elvesztését és a friss GTP felvételét elősegítő fehérjék ellentétes hatása szabályozza. Az utóbbi fehérjéket guanin-nukleotid disszociációs stimulátoroknak (GDS-ek) (vagy más néven guanin-nukleotid felszabadító (vagy cserélő) faktoroknak (GRF-ek) nevezik). A GDS-ként működő fehérjék szekvencia-hasonlóság alapján legalább két családba sorolhatók, a CDC24 családba (lásd InterPro: IPR001331) és ebbe a CDC25 (RasGEF) családba.
A CDC25 család fehérjéinek mérete 309 maradéktól (LTE1) 1596 maradékig (sos) terjed. A szekvencia-hasonlóság, amelyen ezek a fehérjék osztoznak, egy körülbelül 250 aminosavból álló régióra korlátozódik, amely általában a C-terminális részükön található (jelenleg az egyetlen kivétel a sos és a ralGDS, ahol ez a domén a fehérje központi részét alkotja). A CDC25 és az SCD25 esetében kimutatták, hogy ez a domén nélkülözhetetlen e fehérjék aktivitásához.