O abordare alternativă a reglementării de mediu este o abordare de comandă și control. Aceasta este mult mai prescriptivă decât instrumentele bazate pe piață. Instrumentele de reglementare de comandă și control includ standarde de emisii, specificații privind procesele/echipamentele, limite privind intrările/ieșirile/evacuările, cerințe de divulgare a informațiilor și audituri. Abordările de comandă și control au fost criticate pentru restricționarea tehnologiei, deoarece nu ar exista niciun stimulent pentru ca firmele să inoveze. Studiile empirice au arătat contrariul; modificările externe ale prețurilor pot induce inovarea, deoarece întreprinderile sunt forțate să abordeze eșecul pieței de subinvestiție.
Instrumentele bazate pe piață nu impun ca firmele să utilizeze tehnologii specifice sau ca toate firmele să își reducă emisiile cu aceeași valoare, ceea ce permite firmelor o mai mare flexibilitate în abordările lor privind gestionarea poluării. Cu toate acestea, abordările de comandă și control pot fi benefice ca punct de plecare, atunci când autoritățile de reglementare se confruntă cu o problemă semnificativă, dar dispun de prea puține informații pentru a susține un instrument bazat pe piață. Abordările de comandă și control pot fi, de asemenea, preferate atunci când autoritățile de reglementare se confruntă cu o piață subțire, în cazul în care potențialul limitat al bazinelor de tranzacționare înseamnă că câștigurile unui instrument bazat pe piață nu ar depăși costurile (o cerință esențială pentru o abordare de succes bazată pe piață).
Instrumentele bazate pe piață pot fi, de asemenea, nepotrivite în tratarea emisiilor cu impact local, deoarece tranzacționarea ar fi limitată la acea regiune. Ele pot fi, de asemenea, nepotrivite pentru emisiile cu impact global, deoarece cooperarea internațională poate fi dificil de obținut.
Dintr-o serie de motive, apărătorii mediului s-au opus inițial utilizării instrumentelor bazate pe piață, cu excepția unor condiții foarte limitate. Cu toate acestea, după utilizarea cu succes a creditelor comercializate în mod liber în cadrul reducerii treptate a plumbului în SUA, susținătorii mediului au recunoscut că piețele de comercializare au beneficii și pentru mediu. Ulterior, începând cu propunerea pieței de cote pentru ploile acide, susținătorii mediului au sprijinit utilizarea schimburilor comerciale într-o varietate de contexte.