Frecvența mutațiilor proteice în cancer
Graficul „lollipop” de mai sus ilustrează mutațiile missense recurente (observate în 3 sau mai multe din cele 4440 de probe tumorale TCGA din 15 tipuri de cancer) și, prin urmare, potențial oncogene (faceți clic pe „Show Cancer Mutations”). Graficul cu bare de mai jos arată proporția de eșantioane tumorale care au orice fel de mutație(e) modificatoare în proteina dată.
Aflați mai multe despre integrarea datelor despre cancer în PhosphoSitePlus:
Am integrat 4440 de eșantioane tumorale din 15 tipuri de cancer din TCGA (The Cancer Genome Atlas). Pentru a prelua informații mai detaliate despre mutații, vă recomandăm cBioPortal.
Am integrat următoarele tipuri de cancer:
– Leucemie mieloidă acută (TCGA, NEJM 2013)
– Carcinom urotelial de vezică urinară (TCGA, Nature 2014)
– Carcinom invaziv de sân (TCGA, Cell 2015)
– Adenocarcinom colorectal (TCGA, Nature 2012)
– Glioblastom (TCGA, Cell 2013)
– Carcinom cu celule scuamoase la nivelul capului și gâtului (TCGA, Nature 2015)
– Cromofob de rinichi (TCGA, Cancer Cell 2014)
– Carcinom renal cu celule clare de rinichi (TCGA, Nature 2013)
– Adenocarcinom pulmonar (TCGA, Nature 2014)
– Carcinom pulmonar cu celule scuamoase (TCGA, Nature 2012)
– Cistodenocarcinom seros ovarian (TCGA, Nature 2011)
– Carcinom tiroidian papilar (TCGA, Cell 2014)
– Adenocarcinom de prostată (TCGA, Cell 2015)
– Adenocarcinom de stomac (TCGA, Nature 2014)
– Carcinom endometrial de corp uterin (TCGA, Nature 2013)
– Carcinom endometrial de corp uterin (TCGA, Nature 2013)
– Carcinom endometrial de corp uterin (TCGA, Nature 2013)