Domena RasGEF jest domeną występującą w rodzinie CDC25 czynników wymiany nukleotydów guaninowych dla małych GTPaz Rasopodobnych.
| Domena RasGEF | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
Struktura ludzkiego H-Ras.
|
|||||||
| Identyfikatory | |||||||
| Symbol | RasGEF | ||||||
| Pfam | PF00617 | ||||||
| InterPro | IPR001895 | ||||||
| SMART | RasGEF | ||||||
| PROSITE | PDOC00594 | ||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM białko | 1xd4 | ||||||
| CDD | cd00155 | ||||||
| Dostępne struktury białek: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | |||
Białka Ras są związanymi z błoną przełącznikami molekularnymi, które wiążą GTP i GDP oraz powoli hydrolizują GTP do GDP. Równowaga pomiędzy stanem związanym z GTP (aktywnym) i związanym z GDP (nieaktywnym) jest regulowana przez przeciwstawne działanie białek aktywujących aktywność GTPazy i białek promujących utratę związanego GDP i pobór świeżego GTP. Te ostatnie białka znane są jako stymulatory dysocjacji guaninowo-nukleotydowej (GDSs) (lub również jako czynniki uwalniające (lub wymieniające) guaninowo-nukleotydowe (GRFs)). Białka, które działają jako GDS można zaklasyfikować do co najmniej dwóch rodzin, na podstawie podobieństwa sekwencji, rodziny CDC24 (patrz InterPro: IPR001331) i tej rodziny CDC25 (RasGEF).
Wielkość białek rodziny CDC25 waha się od 309 reszt (LTE1) do 1596 reszt (sos). Podobieństwo sekwencji wspólne dla wszystkich tych białek jest ograniczone do regionu około 250 aminokwasów zlokalizowanych na ogół w ich C-końcowym odcinku (obecnie jedynymi wyjątkami są sos i ralGDS, gdzie domena ta stanowi centralną część białka). Wykazano, że domena ta, w przypadku CDC25 i SCD25, jest niezbędna dla aktywności tych białek.