Data 1000 genomů v Ensemblu
Ensembl poskytuje prohlížeč genomů, kde lze prohlížet data projektu 1000 genomů spolu s celou řadou dalších zdrojů dat, a také přístup k nástrojům, které lze použít pro práci s daty 1000 genomů a dalšími soubory dat.
V Ensemblu lze data prohlížet buď na referenční sestavě GRCh37 (používané v závěrečné fázi projektu 1000 genomů), nebo na současném referenčním genomu GRCh38.
- Ensembl GRCh37 – zobrazení dat projektu 1000 genomů na referenčním genomu použitém projektem
- Ensembl GRCh38 – zobrazení dat projektu 1000 genomů na současném lidském referenčním genomu
Během projektu 1000 genomů byla data co nejdříve sdílena prostřednictvím prohlížečů pro včasný přístup pro každou z fází produkce dat projektu. Ty byly vytvořeny, aby umožnily prohlížení předtím, než byla data dostupná v Ensemblu, a nyní byly vyřazeny. Pokud máte jakékoli dotazy týkající se této problematiky, obraťte se na adresu [email protected].
Tutoriály a průvodci
Na hlavní stránce Ensemblu i na jejich blogu jsou k dispozici tipy pro Ensembl.
NCBI také poskytuje prohlížeč 1000 genomů, který je umístěn na jejich stránkách.
Podrobné informace o prohlížeči jsou k dispozici na webových stránkách.