Frekvence proteinových mutací v rakovině
Výše uvedený „lízátkový graf“ znázorňuje rekurentní (pozorované u 3 nebo více ze 4440 vzorků nádorů TCGA z 15 typů rakoviny), a tedy potenciálně onkogenní missense mutace (klikněte na „Zobrazit mutace v rakovině“). Sloupcový graf níže znázorňuje podíl vzorků nádorů, které mají v daném proteinu jakýkoli druh měnící mutace (mutací).
Další informace o integraci dat o rakovině v aplikaci PhosphoSitePlus:
Integrovali jsme 4440 vzorků nádorů z 15 typů rakoviny z databáze TCGA (The Cancer Genome Atlas). Pro získání podrobnějších informací o mutacích doporučujeme cBioPortal.
Integrovali jsme následující typy rakoviny:
– Akutní myeloidní leukémie (TCGA, NEJM 2013)
– Uroteliální karcinom močového měchýře (TCGA, Nature 2014)
– Invazivní karcinom prsu (TCGA, Cell 2015)
– Kolorektální adenokarcinom (TCGA, Nature 2012)
– Glioblastom (TCGA, Cell 2013)
– Spinocelulární karcinom hlavy a krku (TCGA, Nature 2015)
– Chromofobní karcinom ledvin (TCGA, Cancer Cell 2014)
– Světlobuněčný karcinom ledvin (TCGA, Nature 2013)
– Adenokarcinom plic (TCGA, Nature 2014)
– Spinocelulární karcinom plic (TCGA, Nature 2012)
– Serózní cystadenokarcinom vaječníků (TCGA, Nature 2011)
– Papilární karcinom štítné žlázy (TCGA, Cell 2014)
– Adenokarcinom prostaty (TCGA, Cell 2015)
– Adenokarcinom žaludku (TCGA, Nature 2014)
– Endometriální karcinom děložního těla (TCGA, Nature 2013)