RasGEF doména se nachází v rodině CDC25 guanin nukleotidových výměnných faktorů pro malé GTPázy podobné Ras.
| RasGEF doména | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
Struktura lidského H-Ras.
|
|||||||
| Identifikátory | |||||||
| Symbol | RasGEF | ||||||
| Pfam | PF00617 | ||||||
| InterPro | IPR001895 | ||||||
| SMART | RasGEF | ||||||
| PROSITE | PDOC00594 | ||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM protein | 1xd4 | ||||||
| CDD | cd00155 | ||||||
| Dostupné struktury proteinů: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | |||
Bílkoviny Ras jsou molekulární přepínače asociované s membránou, které vážou GTP a GDP a pomalu hydrolyzují GTP na GDP. Rovnováha mezi stavy vázaného GTP (aktivní) a vázaného GDP (neaktivní) je regulována opačným působením proteinů aktivujících aktivitu GTPázy a proteinů, které podporují ztrátu vázaného GDP a příjem čerstvého GTP. Tyto druhé proteiny jsou známé jako stimulátory disociace guanin-nukleotidů (GDS) (nebo také jako faktory uvolňující (nebo vyměňující) guanin-nukleotidy (GRF)). Proteiny, které působí jako GDS, lze na základě sekvenční podobnosti rozdělit přinejmenším do dvou rodin: rodiny CDC24 (viz InterPro: IPR001331) a této rodiny CDC25 (RasGEF).
Velikost proteinů rodiny CDC25 se pohybuje od 309 zbytků (LTE1) do 1596 zbytků (sos). Sekvenční podobnost sdílená všemi těmito proteiny je omezena na oblast přibližně 250 aminokyselin, která se obvykle nachází v jejich C-koncové části (v současné době jsou jedinými výjimkami sos a ralGDS, kde tato doména tvoří centrální část proteinu). Ukázalo se, že tato doména je u CDC25 a SCD25 nezbytná pro aktivitu těchto proteinů
.