1000 Genomes-data i Ensembl
Ensembl tilbyder en genom-browser, hvor 1000 Genomes-projektets data kan ses sammen med en lang række andre datakilder, og som giver adgang til værktøjer, der kan bruges til at arbejde med 1000 Genomes-data og andre datasæt.
I Ensembl kan dataene ses enten på GRCh37-referencemassen (der blev brugt i den sidste fase af 1000-genomprojektet) eller på det nuværende referencegenom, GRCh38.
- Ensembl GRCh37 – se 1000-genomprojektets data på det referencegenom, der blev brugt af projektet
- Ensembl GRCh38 – se 1000-genomprojektets data på det aktuelle menneskelige referencegenom
I løbet af 1000-genomprojektet blev data delt så hurtigt som muligt via browsere med tidlig adgang for hver af projektets dataproduktionsfaser. Disse blev oprettet for at muliggøre browsing, før dataene var tilgængelige i Ensembl, og de er nu blevet trukket tilbage. Hvis du har spørgsmål vedrørende dette, bedes du kontakte [email protected].
Tutorials og vejledninger
Der er tips til Ensembl både på Ensembl’s hovedwebsted og på deres blog.
NNCBI tilbyder også en 1000 genomes-browser, der er hostet på deres websted.