Proteinmutationshyppighed i kræft
Ovenstående “lollipop-plot” illustrerer tilbagevendende (observeret i 3 eller flere ud af 4440 TCGA-tumorprøver fra 15 kræfttyper) og derfor potentielt onkogene missense-mutationer (klik på “Vis kræftmutationer”). Søjleplottet nedenfor viser andelen af tumorprøver, der har nogen form for ændrende mutation(er) i det givne protein.
Få mere at vide om integrationen af kræftdata i PhosphoSitePlus:
Vi integrerede 4440 tumorprøver fra 15 kræfttyper fra TCGA (The Cancer Genome Atlas). For at hente mere detaljerede mutationsoplysninger anbefaler vi cBioPortal.
Vi integrerede følgende kræfttyper:
– Akut myeloid leukæmi (TCGA, NEJM 2013)
– Urothelial karcinom i blæren (TCGA, Nature 2014)
– Invasivt karcinom i brystet (TCGA, Cell 2015)
– Colorectal Adenocarcinom (TCGA, Nature 2012)
– Glioblastom (TCGA, Cell 2013)
– Pladecellekarcinom i hoved og hals (TCGA, Nature 2015)
– Kromofobisk nyre (TCGA, Cancer Cell 2014)
– Renal Clear Cell Carcinoma i nyrerne (TCGA, Nature 2013)
– Lung Adenocarcinoma (TCGA, Nature 2014)
– Lung Squamous Cell Carcinoma (TCGA, Nature 2012)
– Ovarian Serous Cystadenocarcinoma (TCGA, Nature 2011)
– Papillary Thyroid Carcinoma (TCGA, Cell 2014)
– Prostataadenokarcinom (TCGA, Cell 2015)
– Maveadenokarcinom (TCGA, Nature 2014)
– Uterine Corpus Endometrial Carcinoma (TCGA, Nature 2013)
– Uterine Corpus Endometrial Carcinoma (TCGA, Nature 2013)