I 1589 var Paris i realiteten i hænderne på den katolske liga. For at undslippe indkaldte Henrik IV af Frankrig parlamentet i Paris til at mødes i Tours, men kun en lille fraktion af parlamentsmedlemmerne accepterede indkaldelsen. (Henrik holdt også et parlament i Châlons, en by, der fortsat var trofast over for kongen, kendt som parlamentet i Châlons). Efter at kongen var blevet myrdet af den dominikanske lægbroder Jacques Clément, fortsatte “parlamentet i Tours” med at holde møde i de første år af Henrik 4. af Frankrigs regeringstid. De royalistiske medlemmer af de andre provinsparlamenter splittede sig også af – de royalistiske medlemmer af parlamentet i Rouen løsrev sig til Caen, dem i parlamentet i Toulouse til Carcassonne og dem i parlamentet i Dijon til Semur og til Flavigny.
Parlamentet i Paris spillede en vigtig rolle i at stimulere adelen til at modstå udvidelsen af kongemagten med militær magt i den parlamentariske Fronde, 1648-1649. I sidste ende vandt kong Ludvig XIV, og adelen blev ydmyget.
På et møde i parlamentet i Paris den 3. marts 1766, kendt som la Séance de la Flagellation (“Flagellationssessionen”), hævdede Ludvig XV, at den suveræne magt kun lå i hans person.