RasGEF-domæne er et domæne, der findes i CDC25-familien af guaninnukleotidudvekslingsfaktorer for Ras-lignende små GTPaser.
| RasGEF-domæne | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Strukturen af humant H-Ras.
|
||||||||
| Identifikatorer | ||||||||
| Symbol | RasGEF | |||||||
| Pfam | PF00617 | |||||||
| InterPro | IPR001895 | |||||||
| SMART | RasGEF | |||||||
| PROSITE | PDOC00594 | |||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | |||||||
| OPM protein | 1xd4 | |||||||
| CDD | cd00155 | |||||||
| Afailable protein structures: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | PDB | |||
Ras-proteiner er membran-associerede molekylære kontakter, der binder GTP og GDP og langsomt hydrolyserer GTP til GDP. Balancen mellem de GTP-bundne (aktive) og GDP-bundne (inaktive) tilstande reguleres af den modsatte virkning af proteiner, der aktiverer GTPaseaktiviteten, og af proteiner, der fremmer tabet af bundet GDP og optagelsen af frisk GTP. Sidstnævnte proteiner er kendt som guanin-nucleotid-dissociationsstimulatorer (GDS’er) (eller også som guanin-nucleotid-frigivende (eller -udvekslings-) faktorer (GRF’er)). Proteiner, der virker som GDS, kan klassificeres i mindst to familier på grundlag af sekvensligheder, nemlig CDC24-familien (se InterPro: IPR001331) og denne CDC25 (RasGEF)-familie.
Størrelsen af proteinerne i CDC25-familien varierer fra 309 rester (LTE1) til 1596 rester (sos). Den sekvenslighed, der deles af alle disse proteiner, er begrænset til et område på ca. 250 aminosyrer, der generelt er placeret i deres C-terminale del (i øjeblikket er de eneste undtagelser sos og ralGDS, hvor dette domæne udgør den centrale del af proteinet). Det er blevet påvist, at dette domæne i CDC25 og SCD25 er afgørende for disse proteiners aktivitet.