Die FRCC wurde 2007 gegründet, als Ashwaubenon, Bay Port, De Pere und Pulaski die Bay Conference verließen und sich mit einer stärkeren Fox River Valley Conference mit acht Mannschaften zusammenschlossen. Dies geschah vor allem, um die Wettbewerbsbedingungen anzugleichen, da die vier Bay-Schulen größer waren als die meisten anderen Bay-Schulen. 2011 beantragte Green Bay West den Austritt aus der FRCC und Green Bay East bat ebenfalls um den Austritt aus der Konferenz. Sowohl Green Bay East als auch Green Bay West erklärten, sie seien nicht in der Lage, in der FRCC zu konkurrieren. Im Januar 2014 genehmigte die WIAA einen Neuordnungsplan, durch den Green Bay West und Green Bay East aus der FRCC in die Bay Conference aufgenommen wurden. Dieser Plan trat für das Schuljahr 2015-16 in Kraft. Ein weiterer Plan, der nur Football vorsah, wurde 2018 veröffentlicht: West De Pere, Menasha, Green Bay East und Green Bay West würden der Konferenz beitreten, die in zwei Divisionen aufgeteilt werden würde. Der ursprüngliche Plan sah Preble, Bay Port, Green Bay East, Green Bay Southwest, Pulaski, Ashwaubenon und Green Bay West in der einen und Sheboygan North, Sheboygan South, Manitowoc, De Pere, Menasha, West De Pere und Notre Dame in der anderen Division vor. Im Februar 2019 wurde ein überarbeiteter Vorschlag vorgelegt, der Preble, De Pere, Bay Port, Green Bay Southwest, Pulaski, West De Pere und Ashwaubenon in die eine und Sheboygan North, Sheboygan South, Manitowoc, Menasha, Notre Dame, Green Bay East und Green Bay West in die andere Region einschloss. Der Plan wurde im April 2019 genehmigt und soll zum Schuljahr 2020-2021 in Kraft treten.
Aufgrund der COVID-19-Pandemie schlossen sich alle Vollmitglieder der FRCC außer Notre Dame mit einigen Teams der Fox Valley Association und der Wisconsin Valley Conference zusammen, um die 20 Mannschaften umfassende Fox Valley Classic Conference Football Conference zu bilden, die im Frühjahr 2021 spielen wird.