La FRCC a été formée en 2007 lorsque Ashwaubenon, Bay Port, De Pere et Pulaski ont quitté la Bay Conference et se sont joints à une Fox River Valley Conference plus forte de huit équipes. Cette décision a été prise principalement pour uniformiser les règles du jeu, car les quatre écoles de la Baie étaient plus grandes que la plupart des autres écoles de la Baie. En 2011, Green Bay West a demandé à quitter la FRCC et Green Bay East a demandé à quitter la conférence également. Green Bay Est et Ouest ont déclaré qu’ils n’ont pas été en mesure de rivaliser dans la FRCC. En janvier 2014, la WIAA a approuvé un plan de réalignement qui a permis à Green Bay West et Green Bay East de quitter la FRCC et de rejoindre la Bay Conference. Ce plan est entré en vigueur pour l’année scolaire 2015-16. Un autre plan de réalignement portant uniquement sur le football a fait surface en 2018 ; West De Pere, Menasha, Green Bay East et Green Bay West rejoindraient la conférence, qui serait divisée en deux divisions. Le plan original prévoyait que Preble, Bay Port, Green Bay East, Green Bay Southwest, Pulaski, Ashwaubenon et Green Bay West feraient partie de la première division et que Sheboygan North, Sheboygan South, Manitowoc, De Pere, Menasha, West De Pere et Notre Dame feraient partie de la seconde. Une proposition révisée a été présentée en février 2019, celle-ci incluant Preble, De Pere, Bay Port, Green Bay Southwest, Pulaski, West De Pere et Ashwaubenon dans l’une et Sheboygan North, Sheboygan South, Manitowoc, Menasha, Notre Dame, Green Bay East et Green Bay West dans l’autre. Le plan a été approuvé en avril 2019 pour entrer en vigueur pour l’année scolaire 2020-2021.
En raison de la pandémie de COVID-19, tous les membres à part entière de la FRCC en plus de Notre Dame se sont joints à certaines équipes de la Fox Valley Association et de la Wisconsin Valley Conference pour former la conférence de football Fox Valley Classic Conference de 20 équipes, qui jouera au printemps 2021.