A környezetvédelmi szabályozás alternatív megközelítése a parancs és ellenőrzés megközelítése. Ez sokkal előíróbb, mint a piaci alapú eszközök. A parancsoló és ellenőrző szabályozási eszközök közé tartoznak a kibocsátási normák, a folyamatokra/berendezésekre vonatkozó előírások, az inputra/kiadásra/kibocsátásra/kibocsátásra vonatkozó korlátozások, az információk közzétételére vonatkozó követelmények és az auditok. A parancsra és ellenőrzésre épülő megközelítéseket kritizálták a technológia korlátozása miatt, mivel nem ösztönzik a cégeket az innovációra. Empirikus tanulmányok ennek ellenkezőjét mutatták ki; a külső árváltozások ösztönözhetik az innovációt, mivel a vállalatok kénytelenek kezelni az alulinvesztésből adódó piaci kudarcot.
A piaci alapú eszközök nem írják elő, hogy a vállalatok meghatározott technológiákat használjanak, vagy hogy minden vállalat ugyanolyan mértékben csökkentse a kibocsátását, ami nagyobb rugalmasságot biztosít a vállalatok számára a szennyezéskezeléssel kapcsolatos megközelítéseikben. A parancsuralmi megközelítések azonban kiindulási pontként hasznosak lehetnek, amikor a szabályozók jelentős problémával szembesülnek, de túl kevés információval rendelkeznek ahhoz, hogy piaci alapú eszközt támogassanak. A parancsra és ellenőrzésre épülő megközelítések akkor is előnyösek lehetnek, ha a szabályozók vékony piaccal szembesülnek, ahol a korlátozott potenciális kereskedési poolok miatt a piaci alapú eszközből származó nyereség nem haladná meg a költségeket (a sikeres piaci alapú megközelítés egyik legfontosabb követelménye).
A piaci alapú eszközök nem megfelelőek a helyi hatású kibocsátások kezelésében sem, mivel a kereskedelem az adott régióra korlátozódna. A globális hatású kibocsátások esetében is alkalmatlanok lehetnek, mivel a nemzetközi együttműködés nehezen megvalósítható.
A környezetvédők számos okból kifolyólag kezdetben ellenezték a piaci alapú eszközök alkalmazását, kivéve nagyon korlátozott feltételek mellett. Miután azonban az Egyesült Államokban a szabadon forgalmazott krediteket sikeresen alkalmazták az ólom fokozatos csökkentésében, a környezetvédők felismerték, hogy a kereskedelmi piacok a környezet számára is előnyökkel járnak. Ezt követően, a savas eső kibocsátási egységek piacára vonatkozó javaslattal kezdődően a környezetvédők számos összefüggésben támogatták a kereskedelem alkalmazását.