1000 Genomes data in Ensembl
Ensemblでは、1000 Genomesプロジェクトのデータを幅広い追加データソースと一緒に閲覧できるゲノムブラウザと、1000 Genomesデータなどのデータセットを操作するためのツールへのアクセスが可能になっています。
Ensemblでは、GRCh37参照アセンブリ(1000ゲノムプロジェクトの最終フェーズで使用)または現在の参照ゲノムであるGRCh38でデータを表示することができます。
- Ensembl GRCh37 – view the 1000 Genomes Project data on the reference genome used by the project
- Ensembl GRCh38 – view the 1000 Genomes Project data on the current human reference genome
1000 Genomes Project期間中は、データ作成段階ごとに早期アクセスブラウザでできるだけ早くデータが共有されました。 これは、Ensemblでデータが利用可能になる前に閲覧できるようにするために作成されたもので、現在では廃止されています。 この件に関するご質問は、[email protected]。
チュートリアルとガイド
メインEnsemblサイトとブログの両方にEnsemblのヒントがあります。
NCBIも1000ゲノムブラウザを彼らのサイトでホスティングしています。