Protein Mutation Frequency in Cancer
上の「lollipop plot」は、再発（15の癌種からなる4440のTCGA腫瘍サンプルのうち3つ以上で観察）、つまり癌原性ミスセンス変異（「癌変異を表示」をクリックしてください）を示しています。 下の棒グラフは、与えられたタンパク質に何らかの変異を持つ腫瘍サンプルの割合を示しています。
PhosphoSitePlusのがんデータの統合についてはこちらをご覧ください。
TCGA（The Cancer Genome Atlas）の15種類のがんから4440の腫瘍サンプルを統合しました。 より詳細な変異情報を取得するためには、cBioPortalをお勧めします。
以下のがん種を統合しました。
– 急性骨髄性白血病 (TCGA, NEJM 2013)
– 膀胱尿路上皮がん (TCGA, Nature 2014)
– 乳房浸潤がん (TCGA, Cell 2015)
– 大腸腺がん (TCGA.C)
– 大腸がん (TCGA, Nature 2012）
– Glioblastoma（TCGA, Cell 2013）
– Head and Neck Squamous Cell Carcinoma（TCGA, Nature 2015）
– Kidney Chromophobe（TCGA, Cancer Cell 2014）
– Kidney Renal Clear Cell Carcinoma（TCGA.Cancer Cell 2013）
– 腎臓癌（Carcinoma, Cancer Cell 2012）
– 腎臓癌（TCGA.Cancer Cell 2013）
– 肺腺癌（TCGA, Nature 2014）
– 肺扁平上皮癌（TCGA, Nature 2012）
– 卵巣漿膜嚢腺癌（TCGA, Nature 2011）
– 乳頭部甲状腺癌（TCGA, Cell 2014）
– 前立腺腺がん （TCGA, Cell 2015）
– 胃腺がん （TCGA, Nature 2014）
– 子宮体腔内膜がん （TCGA, Nature 2013）