Soil Microbiology

Microbes

Associated Personnel.の略。

  • Kate Reardon 研究微生物学者
  • Katherine Son 物理科学技術者
  • Vacant 研究員、微生物学者(土壌)
  • Vacant 研究員
  • ARS-SWCR 科学者

    共同研究者。

    • Mark Mazzola, USDA-ARS Tree Fruit Research Lab, Wenatchee, WA
    • David Brown, Washington State University, Pullman, WA
    • Kristin Trippe, USDA-ARS Forage Seed and Cereal Research, Corvallis, OR
    • Dick Smiley, Oregon State University, Adams, OR
    • Marion Brodhagen, Western Washington University, Bellingham, WA
    • Jeff McLean, J. St. Craig Venter Institute, La Jolla, CA

    Current Research Projects

    土壌微生物は農業土壌の栄養循環と窒素利用率に大きく寄与しています。 私は、作物管理戦略が在来の土壌微生物群にどのような影響を与えるか、また作物システムが窒素と炭素の動態にどのような影響を与えるかに焦点を当てて研究しています。 これらの影響を理解するため、分子生物学的手法を用い、農業用土壌の栄養循環に重要なバクテリア、真菌、古細菌、線虫などの微生物を定量・同定しています。 また、窒素循環などの特定の微生物機能に必要な遺伝子の存在量の変化も解析しています。 アンモニアから亜硝酸への変換の第一段階を触媒するアンモニアモノオキシゲナーゼをコードする遺伝子などの機能遺伝子を分析することにより、輪作や窒素肥料などの管理戦略が微生物のアンモニア酸化にどのように影響するかを推測することができます。

    分子生物学的能力は、ペンドルトンのUSDA-ARS微生物学プログラムにとって新しいもので、現在はDNA/RNA抽出、ゲル電気泳動、PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)、定量PCR、T-RFLP(微生物多様性の変化を判定する、末端制限断片長多型)、DNA配列決定、蛍光やバイオアナライザーを用いたDNA/RNA定量などが含まれています。

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