Bioinformatik vs. beräkningsbiologi

Sanningen är att de flesta programmeringsbiologer är en blandning av de två disciplinerna.

När man rekryterar till en liten avdelning eller ett nystartat företag blir skillnaden mellan dessa två karikatyrer mycket viktig. Vissa personer kommer att vara inom området för biologin specifikt, och kommer att kvävas när de pressas att utveckla ett verktyg som ska användas av ett team. Andra kommer att hoppa på chansen att skriva en sådan sak. Varje grupp behöver båda dessa. Tänk på de aktuella behoven; kommer den här personen att bygga en pipeline som kommer att återanvändas om och om igen? Eller kommer de att undersöka särskilda varianter eller särskilda svarsprofiler för sammansättningar? Att anpassa rätt person till jobbet garanterar en nöjd anställd och hög produktivitet.

Att ta reda på vilken typ av bakgrund och vilka preferenser någon har kan vara lika enkelt som att fråga honom eller henne. Deras CV eller LinkedIn-profil kan också ge ledtrådar. En programvarufokuserad person tenderar att ha ett eller flera stora bioinformatiska programvaruverktyg med öppen källkod tydligt listade. Deras referenslista kan innehålla några artiklar som beskriver detta projekt och andra (potentiellt många andra) som använder det verktyget. En person som är inriktad på manuskript är inte lika benägen att ha en stor del av sitt CV som handlar om verktygsbyggande. Istället kommer de att lista en rad biologi eller dataset-fokuserade projekt, med manuskript som beskriver varje projekt.

Datavetenskap

Men var passar datavetenskap in i allt detta? Det är åtminstone enkelt: bioinformatik/beräkningsbiologi är datavetenskap med en biologisk tillämpning, precis som beräkningskemi är datavetenskap för kemi. Fysikerna har kommit på att de alla redan är datavetare, så det finns inget behov av ett namn för dem utöver ”fysiker”. Jag hoppas att vi i framtiden kommer att göra detsamma och bara kalla oss ”biologer”.

-Eleanor

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.