Byggnaden på Bleecker Street 144 i Greenwich Village som så småningom skulle inrymma Bleecker Street Cinema byggdes ursprungligen 1832 som två radhus på 144 och 146 Bleecker Street. Placido Mori byggde om 144 till restaurang Mori 1883. Som arkitekturhistorikern Christopher Gray skrev:
Vid någon tidpunkt blev Mori vän med en nybörjararkitekt, Raymond Hood, gav honom en huslapp och en lägenhet på övervåningen och lät honom 1920 designa en ny fasad för byggnaden för att inkludera 146 Bleecker. Hood gav byggnaderna en rad doriska kolonner tvärs över första våningen, imiterade federala överstycken över fönstren och en penthouse-studio med en förskjutning.
Mori stängde 1937. Byggnaden förblev obebodd fram till 1944 då politiska och aktivistiska organisationer, däribland Free World House, hade sitt huvudkontor där i två år. Någon gång därefter blev utrymmet restaurang Montparnasse. År 1959 ägdes byggnaden av New York University.
Filmmakare och social aktivist Lionel Rogosin grundade 1960 Bleecker Street Cinema med 200 platser för att visa sin kontroversiella film Come Back, Africa från 1959. I början av 1960-talet visade den oberoende filmskapargruppen The Film-Makers’ Cooperative, som Rogosin var en anhängare av, experimentella filmer där som midnattsvisningar. Snart blev platsen, med filmkritikern och historikern James Hobermans ord, ett av ”tre viktiga revivalhus”: The New Yorker, Bleecker Street och Thalia” i New York City under 1950- och 1960-talen.
Filmkritikern Rudy Franchi, som en gång i tiden var teaterns programchef, minns att husets katt, Breathless, uppkallad efter Godardfilmen, ofta ”rymde från kontorsområdet och började klättra upp på filmduken”. … Ibland fick jag ett samtal på hustelefonen från projektionsbåset med det knapphändiga meddelandet ’Katten är på filmduken’.” Teaterkatten vid stängningen 1990 fick namnet Wim, efter regissören Wim Wenders.
Sid Geffen köpte teatern 1973 eller 1974 och drev den tillsammans med sin fru, som då hette Jackie Raynal. Samma år köpte Geffen Carnegie Hall Cinema, som låg under den berömda musikhallen. Bingham Ray, framtida medgrundare av October Films och studiochef för United Artists, inledde sin filmkarriär 1981 som manager och programledare på biografen, och Bruce Goldstein, mångårig programledare för Film Forum och filmhistoriker, fick sitt första teaterjobb i New York på Geffens båda ställen. Geffen dog 1986.
År 1990 sade hans änka, som då var omgift och hette Jackie Raynal-Sarré, att eftersom Geffen inte lämnade något testamente efter sig, samarbetade hon med byggherren John Souto för att köpa ut Geffens barn från ett tidigare äktenskap. Hon sade vidare att Souto, efter att ha hyrt ut till henne i fyra år för 160 000 dollar per år, höjde hyran till 275 000 dollar, vilket var mer än vad teatern kunde bära. Efter en stämning och domstolsförhandlingar beordrade en domare de två delägarna att lägga bud på byggnaden. ”Vi kom in med 3,3 miljoner dollar och han kom in med 3,4 miljoner dollar”, sade Raynal-Sarré. I sin slutliga utformning hade teatern en huvudaula med 171 platser och James Agee Room med 78 platser.
Teatern stängdes den 6 september 1990. Den sista filmen som började var Aki Kaurismäkis 74 minuter långa Ariel, och den sista filmen som avslutades var den nästan två timmar långa Jesus från Montreal. Den sista filmen i James Agee Room var Roger Stiglanos Fun Down There. I november samma år hade det åter öppnat som en biograf för homosexuell vuxenfilm. Någon gång efteråt återgick den till sina rötter som konstfilm och stängde sedan en sista gång måndag kväll den 2 september 1991. De sista filmerna var Alex van Warmerdams holländska komedi Voyeur, dokumentären Jimi Hendrix at the Isle of Wight, Ari Roussimofs krigsveterandrama Shadows in the City och Francis Teris skräckfilm Suckling. Teaterns sista operatör var Nick Russo Nicolaou.