1000 Genomes data i Ensembl
Ensembl tillhandahåller en genomwebbläsare där data från 1000 Genomes-projektet kan visas tillsammans med ett stort antal andra datakällor, samt ger tillgång till verktyg som kan användas för att arbeta med 1000 Genomes-data och andra datamängder.
I Ensembl kan data visas antingen på referensgenomet GRCh37 (som användes i slutfasen av 1000 Genomes-projektet) eller på det nuvarande referensgenomet GRCh38.
- Ensembl GRCh37 – visa data från 1000 Genomes Project på det referensgenom som användes av projektet
- Ensembl GRCh38 – visa data från 1000 Genomes Project på det aktuella mänskliga referensgenomet
Under 1000 Genomes Project delades data så snart som möjligt via webbläsare för tidig åtkomst för var och en av projektets dataproduktionsfaser. Dessa skapades för att möjliggöra bläddring innan data var tillgängliga i Ensembl och har nu dragits tillbaka. Om du har några frågor om detta kan du kontakta [email protected].
Tutorials och guider
Det finns tips för Ensembl både på Ensembls huvudwebbplats och på deras blogg.
NCBI tillhandahåller också en webbläsare för 1000 genomes som finns på deras webbplats.