Proteinmutationsfrekvens i cancer
Den ”lollipop plot” ovan illustrerar återkommande (observerade i 3 eller fler av 4440 TCGA-tumörprover från 15 cancertyper) och därmed potentiellt onkogena missense-mutationer (klicka på ”Visa cancermutationer”). Stapeldiagrammet nedan visar andelen tumörprover som har någon form av förändrande mutation(er) i det givna proteinet.
Läs mer om integrationen av cancerdata i PhosphoSitePlus:
Vi integrerade 4440 tumörprover från 15 cancertyper från TCGA (The Cancer Genome Atlas). För att hämta mer detaljerad mutationsinformation rekommenderar vi cBioPortal.
Vi integrerade följande cancertyper:
– Akut myeloisk leukemi (TCGA, NEJM 2013)
– Urothelialkarcinom i urinblåsan (TCGA, Nature 2014)
– Invasivt karcinom i bröstet (TCGA, Cell 2015)
– Kolorektala adenokarcinom (TCGA, Nature 2012)
– Glioblastom (TCGA, Cell 2013)
– Skivepitelcancer i huvud och hals (TCGA, Nature 2015)
– Kromofobiskt kromosom i njurarna (TCGA, Cancer Cell 2014)
– Renalt klarcellscancer i njurarna (TCGA, Nature 2013)
– Lung Adenokarcinom (TCGA, Nature 2014)
– Lung Skivepitelcancer i lungan (TCGA, Nature 2012)
– Ovariecancer i äggstockarna (TCGA, Nature 2011)
– Papillärt sköldkörtelcancer (TCGA, Cell 2014)
– Prostatacancer (TCGA, Cell 2015)
– Adenokarcinom i magsäcken (TCGA, Nature 2014)
– Endometriekarcinom i livmoderkroppen (TCGA, Nature 2013)