RasGEF-domän är en domän som finns i CDC25-familjen av guaninnukleotidutbytesfaktorer för Ras-liknande små GTPaser.
| RasGEF-domän | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
Struktur av humant H-Ras.
|
|||||||
| Identifieringar | |||||||
| Symbol | RasGEF | ||||||
| Pfam | PF00617 | ||||||
| InterPro | IPR001895 | ||||||
| SMART | RasGEF | ||||||
| PROSITE | PDOC00594 | ||||||
| SCOP2 | 1bkd / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM protein | 1xd4 | ||||||
| CDD | cd00155 | ||||||
| Förhandlingsbara proteinstrukturer: | Pfam | PDB | PDBsum | PDB | |||
Ras-proteiner är membranassocierade molekylära brytare som binder GTP och GDP och långsamt hydrolyserar GTP till GDP. Balansen mellan de GTP-bundna (aktiva) och GDP-bundna (inaktiva) tillstånden regleras av den motsatta verkan av proteiner som aktiverar GTPasaktiviteten och av proteiner som främjar förlusten av bundet GDP och upptag av nytt GTP. De sistnämnda proteinerna kallas guanin-nukleotiddissociationsstimulatorer (GDS) (eller även guanin-nukleotidfrisättande (eller utbytes-) faktorer (GRF)). Proteiner som fungerar som GDS kan klassificeras i minst två familjer på grundval av sekvenslikheter, CDC24-familjen (se InterPro: IPR001331) och denna CDC25-familj (RasGEF).
Storleken på proteinerna i CDC25-familjen varierar från 309 rester (LTE1) till 1596 rester (sos). Den sekvenslikhet som delas av alla dessa proteiner är begränsad till en region på cirka 250 aminosyror som i allmänhet är belägen i deras C-terminala sektion (för närvarande är de enda undantagen sos och ralGDS där denna domän utgör den centrala delen av proteinet). Denna domän har i CDC25 och SCD25 visat sig vara nödvändig för dessa proteiners aktivitet.