Bioinformatika vs. výpočetní biologie

Pravdou je, že většina programujících biologů je směsicí obou oborů.

Při najímání pracovníků pro malé oddělení nebo startup je rozlišení těchto dvou karikatur velmi důležité. Někteří lidé budou v oboru speciálně kvůli biologii a budou se dusit, když budou tlačeni k vývoji nástroje pro použití v týmu. Jiní po možnosti napsat takovou věc skočí. Každá skupina potřebuje obojí. Zvažte aktuální potřeby; bude tento člověk vytvářet potrubí, které se bude opakovaně používat? Nebo bude zkoumat konkrétní varianty nebo konkrétní profily odezvy sloučenin? Vhodně zvolená osoba zajistí spokojeného zaměstnance a vysokou produktivitu.

Zjistit, jaké má kdo zázemí a preference, může být tak jednoduché, jako se ho zeptat. Vodítkem může být i jejich životopis nebo profil na síti LinkedIn. Člověk zaměřený na software bude mít obvykle na viditelném místě uveden jeden nebo více velkých bioinformatických softwarových nástrojů s otevřeným zdrojovým kódem. Jejich seznam referencí může obsahovat několik článků popisujících tento projekt a další (případně mnoho dalších), které tento nástroj používají. U osoby zaměřené na rukopisy nebude tak pravděpodobné, že bude mít ve svém životopise významný segment týkající se tvorby nástrojů. Místo toho bude uvádět řadu projektů zaměřených na biologii nebo datové sady, přičemž každý z nich bude popisovat rukopis.

Data Science

Ale jak do toho všeho zapadá data science? To je přinejmenším jednoduché; bioinformatika/počítačová biologie je datová věda s aplikací v biologii, stejně jako výpočetní chemie je datová věda pro chemii. Fyzikové už přišli na to, že jsou všichni datoví vědci, takže pro ně není potřeba jiné označení než „fyzik“. Doufám, že v budoucnu uděláme totéž a budeme si říkat prostě „biologové“.

-Eleanor

.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.